本申请提出了基因工程菌及其在生产L‑色氨酸中的应用，所述基因工程菌包括：来源于Herbaspirillumaquaticum的L‑色氨酸转运蛋白和/或来源于Paraburkholderiaacidisoli的L‑色氨酸转运蛋白；所述基因工程菌的初始菌选自大肠杆菌或谷氨酸棒杆菌。本申请的基因工程菌中引入来源于Herbaspirillumaquaticum和/或Paraburkholderiaacidisoli的L‑色氨酸转运蛋白，可以显著提高基因工程菌发酵生产L‑色氨酸的产量，具有广阔的应用前景。