本发明公开一种虾青素融合蛋白及其构建方法，该方法包括：NCBI数据库中查找虾青素合成基因对应的氨基酸序列；使用生物信息学分析网站和软件对将要融合的蛋白进行结构以及功能上的分析，预测蛋白序列中潜在的磷酸化、糖基化、甲基化修饰位点；将虾青素合成基因的氨基酸序列输入Linker Database在线蛋白接头数据库，根据上述步骤分析的结构性质选定蛋白接头Linker；将设计好的融合蛋白序列输入AlphaFold2中进行模拟构建，输出预测的蛋白三维模拟示意图并进行分析；将设计好的蛋白接头Linker克隆到表达载体，与目标蛋白进行连接，以构建出虾青素融合蛋白。该方法使得酶的稳定性和活性得到提高，使其更好地适应特定的环境或应用需求。