本发明提供一种可储备导电聚合物的跨界面深孔阵列神经电极及制备工艺，神经电极包括基底层、导电层、顶部封装层以及导电聚合物PEDOT:PSS涂层；电极点暴露表面内分布有跨界面深孔阵列，贯穿导电层并在基底层内形成盲孔；PEDOT:PSS填充深孔阵列并覆盖电极点暴露表面。深孔阵列像蓄水池一样，储备导电聚合物PEDOT:PSS，具有优异的电荷存储能力和电荷注入能力，为长期进行信号采集和电刺激的神经电极提供了创新方案。本发明突破了神经电极常用表面改性方法，利用贯穿导电层的深孔阵列，在深度方向积累改性材料，能够承受电极点顶面、深孔内涂层材料局部或完全脱落的影响，保持良好的电化学性能，同时结构新颖，工艺简单，有效解决了导电聚合物涂层材料容易脱落失效这一关键难题。