本发明属于药品包装生产技术领域，涉及一种大批量双腔预充注射容器灌装冻干生产线，包括机架，机架上设有冻干前灌装设备、多台冻干机、冻干后加塞灌装封塞设备和冻干巢板座转运输送线，冻干巢板座转运输送线分别与冻干前灌装设备、多台冻干机和冻干后加塞灌装封塞设备对接。本发明加工包装过程都在A级无菌环境中进行，药品的安全性更可控，可追溯性更强；冻干直接在注射容器内完成，无药液浪费；整套设备集成度高，占用厂房面积更小，设备的运行成本更低；并且可以实现大批量生产，满足市场需求。