本发明公开了多种三氟苯嘧啶共晶、共无定型及其制备方法和应用，涉及药物晶体工程技术领域。具体地，本发明公开了三氟苯嘧啶与有机酸结合形成的十六种共晶和两种共无定型及其制备方法。所述优选的三氟苯嘧啶共晶和共无定型具有优异的稳定性，对溶解性能有较大的调整，适合不同剂型的加工。其中与没食子酸、3,5‑二硝基苯甲酸、反式肉桂酸等的共晶使三氟苯嘧啶的平衡溶解度降低更适合制备成悬浮剂；与2,3,4‑三羟基苯甲酸、原儿茶酸、对羟基苯甲酸等形成的共晶以及与2,4,6‑三羟基苯甲酸或2,6‑二羟基苯甲酸形成的共无定型显著提升了三氟苯嘧啶的平衡溶解度，使之更有利于制备成水分散粒剂，为三氟苯嘧啶制剂的选择提供了更多的可能。