本发明提供了数据传输技术领域的一种基于多重加密的智能终端路由方法及系统，方法包括：步骤S1、服务器将路由规则批量下发给对应的路由器；步骤S2、智能终端对运行数据进行压缩得到压缩数据；步骤S3、对压缩数据进行加密得到第一加密数据；步骤S4、将第一加密数据绑定设备ID后发送给路由器；步骤S5、路由器解密第一加密数据得到压缩数据，对压缩数据进行加密得到第二加密数据；步骤S6、基于设备ID匹配路由规则以对第二加密数据进行路由；步骤S7、服务器对各路由器的路由规则进行巡检；步骤S8、服务器基于管理指令对路由规则进行增删改查的管理，将更新后的路由规则同步给路由器。本发明的优点在于：极大的提升了智能终端路由的安全性以及灵活性。