本发明公开了一种基于有限元的特殊螺纹设计方法、系统、装置及介质，包括：基于特殊螺纹的物理状态和物理参数，构建几何模型；基于特殊螺纹的安装情况，对所构建的几何模块进行优化；基于特殊螺纹的材料性能参数和边界条件对优化后的几何模型进行有限元仿真计算，获取特殊螺纹的应力应变参数；基于特殊螺纹接头的应力应变参数，判断特殊螺纹是否出现屈服现象，若否，输出设计结果。本发明实现对结构的循环计算并改进，能够降低其试验室试制频率和试验成本，缩短试验周期。