本发明涉及轴向磁通电机技术领域，尤其涉及一种综合散热系统及轴向磁通电机，旨在解决现有电机只能对转子进行冷却的问题。本发明提供的综合散热系统包括电机主轴、电机壳体、转子单元和定子单元；并形成由径向气道、连通气道、回流气道、回风孔、主轴内腔和出风孔依次连通组成的成循环气道；以及第一环形流道、第二环形流道和径向流道组成的冷却通道。本发明提供的综合散热系统通过循环气道与冷却通道的相互配合加强对电机壳体内部的冷却效果，即循环气道使热量均匀分布，从而借助冷却通道对循环气道内运行的气体进行冷却，避免了电机只能对转子进行冷却的情况，保证了电机性能和运行平稳。