本发明公开了一种多尺度波浪仿真预报方法和存储介质，涉及波浪仿真技术领域。该方法包括：构建大尺度模型、中尺度模型和小尺度模型；获取待仿真参数，并将待仿真参数输入至大尺度模型、中尺度模型和小尺度模型；确定大尺度模型、中尺度模型和小尺度模型的共同网格点，按照大尺度模型、中尺度模型和小尺度模型的网格参数要求，确定网格点的网格划分；根据网格划分，通过大尺度模型、中尺度模型和小尺度模型，对待仿真参数进行并行求解，获得计算结果。根据本发明实施例的方法，能够模拟任意复杂近岸区域，能够匹配预设的计算资源进行最优化计算，计算任意长时间序列的波浪参数问题，对近岸工程建设有较大的应用价值。