本发明提供了一种基于频率稳定约束的系统优化调度方法和系统，包括：将系统中的同步机组与新能源机组进行聚合等值，获得包含新能源机组的系统等效频率响应模型；通过时序分段求解限幅情况下系统各阶段的所述系统等效频率响应模型，获得在限幅各个阶段的系统频率的动态响应过程；根据所述动态响应过程，获得频率最低点与备用关系的方程组；通过求解所述方程组，获得备用受限下暂态频率稳定对备用机组分配的约束；基于所述备用机组分配的约束和系统的常规约束，确定机组发电计划及发电成本。提高了系统在给定故障发生后的暂态频率稳定性。