本发明公开了基于交叉注意力的鲁棒射频指纹识别方法，具体按照以下步骤实施：步骤1、获取无线通信设备的信号，得到信号的分段对数谱；步骤2、对所述步骤1中的分段对数谱进行滑窗操作，构建分段对数谱嵌入方式，加入绝对位置编码，构建嵌入模块；步骤3、取信道相关时间外的同一设备的两帧数据，按照步骤1～步骤2操作，并将输出结果送入编码模块；步骤4、将编码模块输出结果送入分类网络中得到分类概率；步骤5、以步骤1～步骤4构建整体网络模型，使用训练样本集训练网络，并用测试样本测试网络效果，得到识别准确率。本发明解决了实际场景中信道条件不同时存在的鲁棒性较差的问题，有效提高设备的识别准确率。