本申请公开了一种用于乳酸菌多肽自动拆分的核酸分子、多肽制品的制备方法及其在制备化妆品中的应用。本申请的用于乳酸菌多肽自动拆分的核酸分子依次包括C‑(A‑B)n‑1‑An，其中，n为正整数，n为2至20，其中C表示信号片段、A表示活性片段、B表示剪切片段；其中，所述剪切片段的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示，所述信号片段的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示。该核酸分子在菌株体内合成串联多肽会自动拆分成多个单独的多肽，显著提升单次培养表达多肽的数量，并显著增强功效。极大提高了多肽的生产效率，降低了成本。