本发明公开了一种脉冲电场辅助酸解制备玉米淀粉纳米晶体的方法，先用1～12kV/cm的脉冲电场对淀粉溶液处理，再进行酸解制备淀粉纳米晶体，简单且高效，不仅能够显著降低反应时间，能在较短时间内制备出玉米淀粉纳米晶体，而且由于反应条件温和，安全性能更高，能耗低，也避免温度瞬时升高对淀粉酸解的不利影响，提高结晶度的同时获得尺寸更小的玉米淀粉纳米晶体，可用于复合材料的填充剂，提高其力学性能和阻隔性能，并适于用作食品或日化领域的乳液或包埋材料。