本发明涉及生态环境修复技术领域，公开了一种复合基质及其制备方法和应用，复合基质由以下重量份的原料组成：土壤90～150份、农业废弃物30～50份、园林废弃物16～28份、腐殖酸25～35份、黑水虻粪便16～27份、膨润土8～15份、污泥20～40份。制备方法：制备生物炭；将配方量的土壤、腐殖酸、黑水虻粪便、膨润土、污泥，和制得的生物质炭混合，得所述复合基质。所述的复合基质在生态修复中的应用。本发明向土壤中加入了腐殖酸、黑水虻粪便、膨润土、污泥，以及由农业废弃物、园林废弃物制备的生物炭，通过协同配合，使该复合基质能够用于生态修复中，达到保水保肥的效果，进而促进植物生长。