本发明属于电解镁装备技术领域，具体涉及一种镁电解槽用母线配置方法和系统，所述镁电解槽用母线配置系统，包括阳极主母线、阴极主母线、阳极支母线、阴极支母线和电解槽，所述阳极主母线位于电解槽上方，所述阳极支母线的一端与阳极连接，另一端与阳极主母线连接，所述阳极支母线位于阳极上方；所述阴极支母线位于阴极导电板一侧，所述阴极支母线的一端与阴极导电板连接，另一端与阴极主母线连接。本发明采用有限元磁场计算的方式的母线的配置优化了电磁场分布，减少了“三场”问题对电解槽的影响。另外，本发明提升了电流均匀分布，减少了铝母线用量，从而降低母线装置成本。