本发明提供了一种利用内生菌群促进茶树产生次生代谢产物的方法，属于植物与微生物互作技术领域。本发明提供的方法，首先培养内生真菌菌株，然后筛选出具有促生效果的内生真菌菌株，经扩大培养和混合，得到含内生真菌群的菌液，再将含内生菌群的菌液施用于茶树，构建内生真菌与宿主茶树的共生体，提高茶树茶叶中茶多酚、可可碱、咖啡碱、儿茶素等含量。本发明利用内生菌群促进茶树产生次生代谢产物，可有效规避现有植物提取和化学合成法的技术复杂、成本高、环境污染等弊端，且本发明提供的方法，操作简单，成本低。