本申请属于农副食品加工技术领域，更具体地，涉及一种顺序双频超声破壁油菜籽促进传质的方法。本申请通过将脱皮油菜籽和中性盐溶液混匀后进行顺序双频超声处理，通过依次使用第一频率超声处理第一时间和使用第二频率超声处理第二时间，第一频率小于第二频率，第一时间小于等于第二时间，能够控制脱皮油菜籽细胞的破壁程度以及调控脱皮油菜籽细胞中多酚和蛋白质的传质速度，协同作用使得脱皮油菜籽细胞中的多酚和蛋白质快速且选择性传质到中性盐溶液中。进一步地，本申请提供的方法能够选择性分离脱皮油菜籽溶出的蛋白质和多酚，且蛋白质能够保持较高的提取效率和纯度、具有良好的品质与功能特性。