本发明公开了一种适用于低盐度咸水环境的气幕防咸方法及系统，该方法通过不同方法计算气幕的进气量，并根据计算结果来确定进气量；最后还通过构建的船闸三维数值模型和气幕防咸计算模型优选出气幕设计方案，实现气幕在低盐度咸水环境的阻咸效果。该方法利用气幕实现低盐度咸水防咸，克服了传统防咸方法中认为气幕不适用于低盐度咸水防咸的技术偏见，通过构建气幕防咸计算模型来确定气幕设计的最佳参数，并通过防咸效果的评比，验证了适用于低盐度咸水环境的气幕防咸方法的有效性。