本申请涉及一种时差法流量在线监测动态计算模型生成方法、系统及介质，方法包括如下步骤：在线监测流量比测收集及数据筛选；建立超声波时差法推求模型及目标函数，确定模型计算中的约束条件；基于建立的目标函数，采用粒子群优化算法对时差法推求模型进行迭代计算，推求最优解；根据实际水文监测生产应用中进行深度学习，将新的工况加入模型中进行二次优化求解；基于最优解，生成超声波时差法计算模型。本申请能够应用河道、水库、堰闸等受水利工程影响的水文断面实时流量监测，快捷动态率定流量模型参数，满足水文流量监测规范要求，可广泛应用水文监测、水资源管理等领域。