本发明涉及海洋工程技术领域，尤其涉及桩基式海上光伏安装系统和桩基式海上光伏安装方法；桩基式海上光伏安装系统包括：桩基模块、运输模块和安装模块；桩基模块包括连续的安装滑道和牵引滑道，运输模块包括运输船和光伏单元层架，安装模块包括转移装置、升降装置和运动稳定装置；转移装置具有沿第二方向伸出的直臂段，其上设置有可沿直臂段移动且向上伸出的限位块，升降装置驱动转移装置沿光伏单元层架的高度方向升降；运动稳定装置设置于转移装置和升降装置之间以调整转移装置的角度；本发明无需使用吊装设备并且可实现自动化的光伏单元取放和移动，有效减少人工干预，提高安装效率。