本发明提供了一种填料改良剂及其制备方法和应用，属于填料改良剂技术领域。本发明提供的填料改良剂解决了现有技术中填料改良剂性能不足的问题，通过改良剂成分与填料发生溶解、结晶、吸收、扩散、再结晶的链式化学反应，再在机械荷载的作用下，改变了土体机构，破坏了毛细管，使普通土体改良成致密、均匀、有较高强度、耐久性、抗渗性、抗冻性的优质改良土。采用本发明提供的填料改良剂，无需置换原有填料，就地改良不符合设计要求的填料，降低了施工成本；可以改良粉砂、粉砂、粉土、粉质黏土、黏土等细粒含量过高的填料；提高土体早期强度，从而提高施工效率；使改良后的填料具有抗渗性、抗冻胀性能；可以通过与填料充分拌和后，填筑路基或其他构筑物，也可通过后期注浆的方式充填到路基或地坪中，起到加固、抗冻胀的作用。