本申请涉及状态评估技术领域，具体提供了一种智能电表运行误差与日线损率联合估计方法及系统，所述方法包括：获取初始量测数据：剔除初始量测数据中的异常数据和轻载用户的数据以得到预处理后的量测数据；通过扩展卡尔曼滤波算法的线损率估计系统对预处理后的量测数据进行计算得到台区线损率估计值；将台区线损率估计值输入到基于动态遗忘因子的递推最小二乘法的误差估计系统中得到台区智能电表的误差估计参数；将误差估计参数输入至线损率估计系统中得到新线损率估计值，循环次数依次增加，直至误差估计参数收敛完成以得到误差估计的精确值。解决了线损率估计模型过于理想化的问题，保证了电表误差估计的精度。