本发明涉及地理环境三维重构技术领域，特别涉及一种基于点云的地理环境三维模型构建方法及系统，获取点云数据、无人机影像数据和遥感影像数据；基于卷积神经网络对遥感影像进行建筑物区域的提取，作为裁剪无人机建筑区域的掩膜；提取无人机影像的建筑物区域，通过特征提取和匹配算法将其和遥感影像进行拼接融合；采用顾及地形特征的点云抽稀算法对点云数据进行筛选；基于渐进TIN加密滤波算法，构建研究区域的数字表面模型DSM；采用3D纹理映射技术，基于融合后的影像和处理后的DSM数据，生成面向地理环境快速重构的高精度三维模型。本发明计算效率高，能够大大减少人力和时间成本，对于快速、大范围和近实时的地形环境数据生成提供新途径。