本发明提供了一种无损测量生物活体组织热参数的方法，用于通过三点表面测温确定柱状生物活体组织的热参数。该方法包括：建立柱坐标下柱状生物活体组织的二维Pennes传热模型；采用逐行法求解在阶跃热流或方波热流的干扰作用下，柱状生物活体组织内的温度变化；通过灵敏度计算，分析热参数的灵敏度系数之间的相关性以及热参数对温度变化的影响，优化三个测量点的选择；开发生物活体组织表面温度的测量系统，实时采集温度的瞬态响应数据；应用改进的高斯参数估计方法，同时获得柱状生物活体组织的导热系数、热扩散系数、血液灌注率以及体积热容量等热参数。其优点在于：实现了方便、步骤简单的无损测量。