本发明涉及一种加氢改质异构降凝生产柴油的方法。以馏分油为原料，采用单段或串联工艺流程，在适宜操作条件下，馏分油原料与氢气通过催化剂床层，得到清洁优质柴油产品及少量硫氮含量低、芳烃潜含量高的石脑油产品。所述的催化剂床层包括含β沸石0.5～＜20wt%的加氢处理催化剂。本发明通过选择适宜的工艺流程、工艺条件选择适宜的催化剂，可以使劣质的柴油馏分同时改善凝点、十六烷值、杂质含量、T95、芳烃等多项性能指标，一步生产出性能优良的清洁柴油产品。另外，本发明方法柴油产品收率高，工艺简单，运转稳定。本发明克服了现有技术只能改善柴油某一项指标的不足，可以用于各种含柴油馏分原料生产优质柴油产品。