本实用新型提出了一种海洋资料浮标用燃料电池及海洋资料浮标。本实用新型包括电池本体、通气机构、排水机构和控制器；通气机构包括进气管、出气管和风机，进气管的中部通过通气管与电池本体连接，出气管的中部通过散热管与电池本体连接，风机设置于散热管上，散热管上设有温度传感器；排水机构包括储水罐和水泵，储水罐通过第一进水管与电池本体连接，储水罐通过第二进水管与通气机构连接，储水罐通过第三进水管与通气机构连接，水泵的进水端与储水罐连接，水泵的出水端设有末端延伸至浮标舱外部的排水管。本实用新型通气效果好，热量散发及时，积水排到浮标舱的外部，满足了海洋资料浮标用燃料电池在恶劣海洋环境中的长期、稳定和无人值守运行。