本实用新型公开了一种用于水电控制系统的数字信号滤波装置，包括输入单元、亚稳态消除单元、滤波单元及输出单元：所述输入单元，用于提供待处理的数字信号和预设的参考信号；所述亚稳态消除单元，用于对所述待处理数字信号的亚稳态进行消除，得到亚稳态消除后的数字信号；所述滤波单元，用于对所述亚稳态消除后的数字信号进行滤波处理，得到滤波处理后的数字信号；所述输出单元，用于输出所述滤波处理后的数字信号；本实用新型实现对数字信号的亚稳态消除以及滤波，消除信号在传递过程中出现的亚稳态；同时，能够消除数字信号中存在的干扰，实现稳定的信号输出。