一种酶催化酯交换反应装置，包括具有酶催化酯交换反应槽及螺旋输送装置的反应单元。该酶催化酯交换反应槽具有界定出可密闭的反应空间的反应槽体、至少一设置邻近该反应槽体的顶部或底部的开口、位于该反应槽体的顶部，与该反应空间连通并供导入该入料原料的入料口，及位于该反应槽体的底部供反应物排出的出料口。该螺旋输送装置具有可转动地插设于该反应空间并具有沿该反应槽体的深度方向间隔分布的螺旋叶片，且通过转动该螺旋输送装置可带动所述酶颗粒自该至少一开口装填于该反应空间或于装填新酶颗粒的过程中同步自该反应空间移除旧酶颗粒。