本实用新型公开了一种卷烟烟气对鼠体内外菌群影响的实验装置，包括实验箱，所述实验箱的内部从上至下依次设有网板和分隔板将试验箱分布呈上中下三个分层；实验箱的一侧设有真空泵，所述真空泵的输出端固定连接有第二管道，所述第二管道的另一端与实验箱的中间层相连通，真空泵的输入端固定连接有第一管道，所述第一管道的另一端连接有烟卷固定组件，所述烟卷固定组件与所述实验箱的下层相连通，所述烟卷固定组件为套管组件设置且内部套管能够插入卷烟的烟嘴；所述实验箱另一侧连接有烟气净化组件。本实用新型通过真空泵的抽吸加快了实验的进度，且通过空气净化组件防止残余烟气的排出，净化了环境，也方便更换卷烟。