一种小籽粒气吸式排种器及其清种机构，该小籽粒气吸式排种器包括清种机构，该清种机构包括：清种刮刀，对应于小籽粒气吸式排种器的种室安装在所述小籽粒气吸式排种器的前壳体上，并与所述小籽粒气吸式排种器的种盘抵接；所述清种刮刀为弧形结构，并紧邻所述种盘的型孔中心圆的设置。本实用新型的清种机构安装在种盘的型孔中心圆，待清种子在挤压力和重力共同作用下更容易清落，清种掉落的种子直接落回种室，不会影响种盘上吸附的种子。清种刮刀可进行旋转调节，且工作面均为光滑曲线，作业时种子不会产生剧烈震动导致脱离型孔，不会产生过清现象导致漏播，充分保证了排种合格率，且可调整清种机构位置适应不同外形尺寸的种子。