本实用新型涉及气溶胶采集分离领域，具体公开了一种层叠式微型气溶胶分离器，包括壳体及设于壳体内部的一级分离流道结构和二级分离流道结构；一级分离流道结构和二级分离流道结构均沿壳体的长度方向布置且互相平行；壳体内还设有转向流道，一级分离流道结构的一出气端通过转向流道与二级分离流道结构的进气端相连通，气溶胶在一级分离流道结构和二级分离流道结构中具有相反的流动方向。本实用新型不仅能实现气溶胶的多级分离，而且有利于减小其外轮廓尺寸，提高结构紧凑性。