【課題】製造段階において、不純物が膜電極接合体に付着することを低減することにより、燃料電池単セルの発電性能の低下を抑えることができる燃料電池単セルの製造方法を提供する。 【解決手段】この製造方法では、接着剤13を介して樹脂フレーム15が配置された電極アッセンブリ10を準備する。接着剤13を硬化させながら、接着剤13を介して樹脂フレーム15が接着された側から前記膜電極接合体の周りのガスを吸引する。さらに、セパレータ20、30を接合する際に、樹脂フレーム15を各セパレータ20、30に融着しつつ、各膜電極接合体11に対して、接着剤13を介して樹脂フレーム15が接着された側の流路33内のガスを吸引する。 【選択図】図2