公开(公告)号：CN101238225B

公开(公告)日：2016-11-30

申请号：CN200680028794.6

申请日：2006-07-03

申请人： 伊拉兹马斯大学医疗中心

发明人： 沃特·德拉特 ,  弗兰克·格罗斯维尔德

IPC分类号： C12Q1/68

摘要： 本发明的一个方面涉及分析靶核苷酸序列与一个或多个目的核苷酸序列(如一个或多个基因组基因座)相互作用的频率的方法，其包括如下步骤：(a)提供交联的DNA样品；(b)用第一限制性内切酶消化交联的DNA；(c)连接交联的核苷酸序列；(d)解除交联；(e)用第二限制性内切酶消化核苷酸序列；(f)将已知核苷酸组成的一个或多个DNA序列与在一个或多个目的核苷酸序列侧翼的可用的第二限制性内切酶消化位点连接；(g)利用至少两个寡核苷酸引物扩增一个或多个目的核苷酸序列，其中每个引物与在目的核苷酸序列侧翼的DNA序列杂交；(h)将扩增的一个或多个序列与阵列杂交；和(i)确定DNA序列间相互作用的频率。

公开(公告)号：CN101688237A

公开(公告)日：2010-03-31

申请号：CN200880008027.8

申请日：2008-01-10

申请人： 伊拉兹马斯大学医疗中心

发明人： 沃特·德拉特 ,  弗兰克·格罗斯维尔德

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6823 ,  C12Q2523/101

摘要： 本发明的一个方面涉及分析靶核苷酸序列与一个或多个目的核苷酸序列(如一个或多个基因组基因座)相互作用的频率的方法，其包括如下步骤：(a)提供交联的DNA样品；(b)用第一限制酶消化交联的DNA；(c)连接交联的核苷酸序列；(d)解除交联；(e)任选用第二限制酶消化核苷酸序列；(f)任选将已知核苷酸组成的一个或多个DNA序列与在一个或多个目的核苷酸序列侧翼的可用的第二限制酶消化位点连接；(g)利用至少两个寡核苷酸引物扩增一个或多个目的核苷酸序列，其中每个引物与在目的核苷酸序列侧翼的DNA序列杂交；(h)将扩增的序列与阵列杂交；和(i)确定DNA序列间相互作用的频率。

公开(公告)号：CN101238225A

公开(公告)日：2008-08-06

申请号：CN200680028794.6

申请日：2006-07-03

申请人： 伊拉兹马斯大学医疗中心

发明人： 沃特·德拉特 ,  弗兰克·格罗斯维尔德

IPC分类号： C12Q1/68

摘要： 本发明的一个方面涉及分析靶核苷酸序列与一个或多个目的核苷酸序列(如一个或多个基因组基因座)相互作用的频率的方法，其包括如下步骤：(a)提供交联的DNA样品；(b)用第一限制性内切酶消化交联的DNA；(c)连接交联的核苷酸序列；(d)解除交联；(e)用第二限制性内切酶消化核苷酸序列；(f)将已知核苷酸组成的一个或多个DNA序列与在一个或多个目的核苷酸序列侧翼的可用的第二限制性内切酶消化位点连接；(g)利用至少两个寡核苷酸引物扩增一个或多个目的核苷酸序列，其中每个引物与在目的核苷酸序列侧翼的DNA序列杂交；(h)将扩增的一个或多个序列与阵列杂交；和(i)确定DNA序列间相互作用的频率。