公开(公告)号：CN116110497A

公开(公告)日：2023-05-12

申请号：CN202310162262.7

申请日：2023-02-24

Applicant: 张磊

Inventor： 张磊 ,  靳传娣 ,  生大双 ,  岳凯乐 ,  薛鑫鑫 ,  梁益嘉 ,  岳敏 ,  李平福

IPC: G16B20/30

Abstract: 本发明涉及微生物组学技术领域，具体涉及一种从全转录基因组数据中挖掘微生物数据的方法。所述方法包括以下步骤：步骤1.提取原始测序数据中的非人序列并对其进行质量控制；步骤2.微生物比对及微生物序列过滤：使用kraken2构建标准微生物参考数据库，使用kraken2将步骤1提取的序列与参考数据库进行比对，获得序列的注释信息；基于序列的注释信息将未比对至微生物的序列进行过滤去除，进一步获取微生物序列和微生物物种丰度；步骤3.微生物基因和功能分析。本发明提供了一种更为标准、可靠、完整的从全转录基因组数据中挖掘微生物数据的方法。

公开(公告)号：CN115505592A

公开(公告)日：2022-12-23

申请号：CN202211367839.X

申请日：2022-11-03

Applicant: 张磊

Inventor： 张磊 ,  赵常英 ,  苏真真 ,  梁益嘉 ,  杨斯桀 ,  生大双

IPC: C12N15/10

Abstract: 本发明涉及生物医药技术领域，具体涉及一种真菌DNA模板高效制备方法。所述方法包括以下步骤：将样品进行平板培养、液体培养基富集；离心，弃上清液后加入TE缓冲液，震荡均匀后进行煮沸、冷冻；融化、震荡摇匀，进行超声处理，离心取上清即得。本发明所述方法可以使菌体DNA充分释放，无需DNA的提取，采用所得上清液即可进行PCR；并且本发明所述方法操作简单，用时较短，适用于大批量操作。