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公开(公告)号：CN116110497A
公开(公告)日：2023-05-12
申请号：CN202310162262.7
申请日：2023-02-24
Applicant: 张磊
IPC: G16B20/30
Abstract: 本发明涉及微生物组学技术领域，具体涉及一种从全转录基因组数据中挖掘微生物数据的方法。所述方法包括以下步骤：步骤1.提取原始测序数据中的非人序列并对其进行质量控制；步骤2.微生物比对及微生物序列过滤：使用kraken2构建标准微生物参考数据库，使用kraken2将步骤1提取的序列与参考数据库进行比对，获得序列的注释信息；基于序列的注释信息将未比对至微生物的序列进行过滤去除，进一步获取微生物序列和微生物物种丰度；步骤3.微生物基因和功能分析。本发明提供了一种更为标准、可靠、完整的从全转录基因组数据中挖掘微生物数据的方法。
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