公开(公告)号：CN114774544A

公开(公告)日：2022-07-22

申请号：CN202210391403.8

申请日：2022-04-14

Applicant: 武汉大学中南医院 ,  北京优乐复生科技有限责任公司 ,  中国科学院昆明动物研究所

Inventor： 王行环 ,  肖宇 ,  张翼 ,  钱开宇 ,  彭旻晟 ,  鞠林高 ,  王刚

IPC: C12Q1/6886 ,  C12Q1/6869 ,  C12N15/11 ,  G16B20/30 ,  G16H50/20

Abstract: 本发明公开了一种膀胱癌检测的DNA甲基化多重PCR试剂盒及其应用，所述试剂盒包括：用于膀胱癌检测的DNA甲基化标志物的引物对：引物对1‑7，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1‑SEQ ID NO.14所示。主要用于膀胱癌患者的辅助诊断，在患者手术前进行诊断与类型鉴别，为患者后续的治疗提供有效依据，操作简单，周期较短，大大缩短了对膀胱癌及其病理分型的诊断，有助于更快地为患者提供有效且针对性强的治疗方案，也有助于患者的预后。

公开(公告)号：CN118222685A

公开(公告)日：2024-06-21

申请号：CN202410447082.8

申请日：2024-04-15

Applicant: 中国科学院昆明动物研究所

Inventor： 李建波 ,  彭旻晟 ,  张亚平 ,  李寒 ,  赵卉 ,  张冲 ,  蔡正飞

IPC: C12Q1/6869 ,  C12Q1/6806 ,  C40B50/06

Abstract: 本发明属于细胞工程技术领域，涉及一种适用于生物样本中微量RNA病原核酸的靶向捕获测序技术，主要针对酒精保存的这一类RNA降解严重的样本，采用现有技术的靶向捕获测序方法，捕获效率低，甚至检测不到目标病原的基因组序列。本发明通过提取样本的RNA构建cDNA文库，设计改进的目标病原基因组的探针，构建探针捕获的文库，进行二代测序，通过评估目标病原基因组的覆盖度计算靶向捕获测序技术的捕获效率。结果显示，采用本发明的方法，捕获效率可达95％，效率提升了20％，同时，还节约了成本，对于RNA降解严重的样本的病原鉴定具有重要的作用和意义。

公开(公告)号：CN119380808A

公开(公告)日：2025-01-28

申请号：CN202411295955.4

申请日：2024-09-14

Applicant: 中国科学院昆明动物研究所

Inventor： 张亚平 ,  王浩 ,  郦雪松 ,  周中银 ,  高云 ,  彭旻晟 ,  施贤

IPC: G16B20/30 ,  G06F18/23213 ,  G16B40/30

Abstract: 本发明涉及一种构建撒坝猪鉴定SNP位点集的方法及其应用，包括如下步骤：S1、计算撒坝猪的SNP位点品种得分信息；S2、从上述SNP位点中选取撒坝猪SNP位点，使用K‑means聚类方法分为三个聚类簇；S3、对三个聚类簇的SNP位点进一步选取获得撒坝猪鉴定SNP位点集候选位点排序；S4、候选位点选取前30‑40个位点作为撒坝猪的鉴定SNP位点集。本发明提供的构建撒坝猪鉴定SNP位点集的方法及其应用，可从多个猪品系中快速鉴定撒坝猪，或者从多个待测肉制品中快速鉴定撒坝猪肉，鉴定的理论准确度高达99.21%。本发明具有明显的撒坝猪种属特异性，实用性较强，具备良好的开发和应用前景。

公开(公告)号：CN110858503A

公开(公告)日：2020-03-03

申请号：CN201810927933.3

申请日：2018-08-11

Applicant: 中国科学院昆明动物研究所

Inventor： 马占山 ,  张亚平 ,  李连伟 ,  彭旻晟

IPC: G16B30/20

Abstract: 本发明公开了一种综合应用第三代超长测序读段(Ultra-long reads)和第二代链接式读段(Linked-reads)高效率、高质量从头组装(de Novo)基因组的方法。其中第三代超长测序读段是指通过目前应用最为广泛的第三代测序技术Nanopore和PacBio产生的超长测序读段；第二代链接式读段是指10x Genomics测序平台产生的测序读段，通过高效率的混合组装软件组装出高质量基因组序列。该方法充分发挥了第三代超长测序读段和第二代链接式读段的优势，综合二者之长，结合高效率的组装软件——DBG2OLC和SPARC大幅度降低了第三代测序技术的应用成本。为应用第三代测序技术进行大规模、高质量的基因组从头组装提供了一种高效、可靠、经济的方法。