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公开(公告)号：CN116343925A
公开(公告)日：2023-06-27
申请号：CN202310097886.5
申请日：2023-02-10
Applicant: 中国科学院广州生物医药与健康研究院
Abstract: 本发明公开了一种定量调控基因翻译的方法及其应用。所述方法包括：将目标基因的起始密码子之前的或目标基因的非编码区的上游开放阅读框之前的Kozak序列及其变体的翻译效率进行排序，根据排序结果，按需求对所述Kozak序列进行基因编辑，实现基于原位操纵Kozak序列定量调控基因翻译，所述Kozak序列及其变体的长度各自独立的为3～6bp。本发明建立了一个高效、灵活、适用性极广的基因表达调控方法。通过利用精准基因编辑工具原位定制目标基因的Kozak序列，实现在基因翻译阶段定量地控制基因的表达水平。
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公开(公告)号：CN116121383A
公开(公告)日：2023-05-16
申请号：CN202211649908.6
申请日：2022-12-21
Applicant: 武汉康圣贝泰生物科技有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6806 , C12Q1/6869 , C40B50/06 , C12N15/11 , G16B35/10
Abstract: 本发明提供了一种用于血液恶性肿瘤临床诊疗中的组合物。该组合物是通过数据库获取TCR与BCR重排的特异性引物片段进行配对设计，建立了一个适用于人类免疫组库多重PCR的引物集，可对CDR3序列和不完全重排序列进行多重扩增，该多种检测指标引物，囊括IGH、IGDH、IGK、IGL、TRB‑VJ、TRB‑DJ、TRG、TRD，进一步通过研究表明，该引物集能够在多种血液恶性肿瘤中进行临床多指标检测，并能够显著提高临床样本的阳性检出，可以全面的对患者个体免疫组库进行检测，实现高灵敏度的MRD的追踪，同时，也能够帮助获得机体所有的异常克隆，精确的反应机体免疫状态。
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公开(公告)号：CN115810397A
公开(公告)日：2023-03-17
申请号：CN202211695871.0
申请日：2022-12-28
Applicant: 中国人民解放军空军军医大学
Abstract: 本发明提供了一种藤梨根有效成分靶点分子预测模型的构建方法，属于网络药理学领域，本发明先获取了二氢白桦酸的结构相似化合物，从氨基酸组成、二肽组成、CTD指标这三个特征入手，计算蛋白特征，获得蛋白特征原始数据集；对于蛋白特征原始数据集采用合成少数类过取样算法(SMOTE)处理不平衡数据，之后使用主成分分析法(PCA)达到降维的目的从而完成对数据的处理；在构建模型的过程中本发明采用主流算法Kmeans聚类进行半监督学习，建立出研究所需的训练集、验证集及测试集；最终，通过十折交叉验证法提高其泛化能力，得到预测模型。该模型泛化能力好，可靠性高，分类准确。
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公开(公告)号：CN115547416A
公开(公告)日：2022-12-30
申请号：CN202211264892.7
申请日：2022-10-17
Applicant: 浙江泉生生物科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种源细胞与细胞受者数据的互动筛选方法，包括：获取源细胞的第一生物标志物数据，获取细胞受者的第二数据，根据第一生物标志物数据与第二数据匹配时，筛选与受者第二数据匹配的源细胞，或筛选与源细胞相匹配的第二数据。本发明还公开一种互动筛选源细胞与细胞受者数据的系统及制品。本发明通过对源细胞和细胞受者的各类指标进行检测、筛选，建立相应的细胞数据库，源细胞和细胞受者的各种指标相互匹配，建立一种个性化，互动性、系统性、对应性的可提升有效性的科研或者治疗模式。
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公开(公告)号：CN114783521A
公开(公告)日：2022-07-22
申请号：CN202210278322.7
申请日：2022-03-21
Applicant: 中国科学院深圳理工大学(筹) , 深圳先进技术研究院
Abstract: 本申请适用于生物医药领域，提供了生成活性肽段的方法、装置、设备及存储介质，包括：获取特定活性对应的肽段生成模型，肽段生成模型是利用通用肽数据集和预设的与特定活性对应的活性肽数据集对LSTM网络进行训练得到的，通用肽数据集包括多个通用肽段；利用肽段生成模型生成多个具有特定活性的肽段。上述方案中，肽段生成模型是利用通用肽数据集和预设的与特定活性对应的活性肽数据集对LSTM网络进行训练得到的，其在训练过程中可以学习到通用肽段中的潜在特征，和已知活性肽段中的潜在活性规律，进而使得在实际使用该肽段生成模型的过程中，可根据不同的特定活性需求，生成具有不同特定活性的、多样性丰富的肽段。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN114613430A
公开(公告)日：2022-06-10
申请号：CN202210288608.3
申请日：2022-03-22
Applicant: 苏州清港泉生物科技有限公司
Abstract: 本发明揭示了一种假阳性核苷酸变异位点的过滤方法及计算设备，方法包括以下步骤：获取测序原始数据；测序原始数据通过突变检测软件检测突变位点，判断位点结果并获取突变候选集；特征提取，对每一个突变位点，分别将VAF值、Ratio值、mVAF值列成表格，形成特征数据集矩阵；随机取总数据的10％作为训练集，其余作为测试集，对训练集支持向量机建模，训练得到的模型，使用测试集进行评估；继续优化返回上一步骤，停止优化选定最优模型。本发明实现了只根据非对照样本的突变位点的参数，通过机器学习的支持向量机方案构建预测模型，对由软件运行后的突变位点文件进行假阳性位点的过滤，进而得到真阳性变异位点，从而简化后续样本的识别问题。
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公开(公告)号：CN114008712A9
公开(公告)日：2022-03-22
申请号：CN202080044514.0
申请日：2020-05-11
Applicant: 天才实验室有限公司
Abstract: 本发明提供了生产具有一个或多个期望特性的蛋白质的方法，该方法包括(a)文库设计步骤，(b)文库测试步骤；和(c)学习步骤，其中至少部分基于文库测试步骤的结果为每个序列变体分配适应度分数，并且机器学习算法使用每个序列变体的适应度分数来训练用于预测新序列变体的适应度分数的模型，并且其中在步骤(c)中训练的机器学习模型用于设计新的序列变体文库。本发明还提供了一种用于生产具有一个或多个期望特性的蛋白质的系统，所述系统适于实施本发明的方法。
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公开(公告)号：CN111370056B
公开(公告)日：2021-03-30
申请号：CN201910428251.2
申请日：2019-05-22
Applicant: 深圳思勤医疗科技有限公司
Abstract: 本发明提出了确定待测样本预定染色体不稳定指数的方法。该方法包括：(1)划分窗口序列(bins)；(2)与所述参考序列；(3)统计bins中每一个的匹配测序读段数目；(4)对每个bins的匹配测序读段数目进行过滤，标准化，校正处理；(5)对步骤(4)所获得的结果进行取对数处理，以便获得每个bins的测序读段数目的对数值log R ratio；(6)确定第一预选异常窗口序列；(7)确定第二预选异常窗口序列；(8)确定异常窗口序列；(9)确定所述异常窗口序列的每一个拷贝数变异发生频率；(10)确定所述待测样本针对所述预定染色体的不稳定指数。
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公开(公告)号：CN119207574A
公开(公告)日：2024-12-27
申请号：CN202411719354.1
申请日：2024-11-28
Applicant: 吉林省农业科学院(中国农业科技东北创新中心)
Abstract: 本发明公开了鉴定不同马铃薯品种萌发成苗耐低温特性方法，涉及马铃薯耐低温特性技术领域，为了解决无法使用多方法、多监测手段对不同品种的马铃薯进行耐低温测试的问题。本发明通过在液氮中冷冻标准马铃薯样品并严格检测RNA的浓度、纯度和完整性，确保了RNA提取的高质量，为后续测序提供了可靠的基础，利用高通量测序技术，能够精确获取标准马铃薯样品的RNA测序结果，提高了数据的准确性和可靠性，将基因表达模式与生长指标、生理指标进行关联分析，不仅考虑了基因层面的变化，还结合了表型数据，形成了从基因到表型的全面分析框架，通过实时监测样品马铃薯的发芽率、成苗率及生长指标，能够精确捕捉马铃薯在不同生长阶段的反应。
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公开(公告)号：CN114373509B
公开(公告)日：2024-10-29
申请号：CN202111569787.X
申请日：2021-12-21
Applicant: 南京邮电大学 , 南京趣集客信息技术有限公司
IPC: G16B35/10
Abstract: 本发明公开了一种基于GPU加速AutoDock Vina的方法及实现，该方法通过增加初始随机配体构象的数目来扩展蒙特卡罗的迭代局部搜索方法中对接线程的并行规模，减少蒙特卡罗的迭代局部搜索方法中的搜索步数，利用OpenCL实现AutoDock Vina中CPU和GPU异构并行结构以此达到更高水平的并行和加速能力。现代药物筛选需要面对海量的化合物数据，目前的分子对接技术无法满足现实需求。采用本发明的方法，可以在保证不损失对接精度的同时大幅加快分子对接和虚拟筛选的速度，满足大型化合物数据库分子对接的实际需求。
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