基于高光谱成像的作物籽粒代谢性状检测和遗传解析方法

    公开(公告)号:CN113393897A

    公开(公告)日:2021-09-14

    申请号:CN202110707252.8

    申请日:2021-06-22

    IPC分类号: G16B20/20

    摘要: 本发明公开了一种基于高光谱成像的作物籽粒代谢性状检测和遗传解析方法。首先利用高光谱相机采集作物籽粒的高光谱图像,得到上千种作物籽粒高光谱指数,其次利用气相/高效液相色谱‑串联质谱法检测上千种代谢物;基于群体各株系的基因分型信息,分别以高光谱指数和代谢物含量作为作物籽粒表型性状进行全基因组关联分析,筛选显著SNP位点,对两组显著SNP位点进行共定位分析,构建高光谱表型‑基因型‑代谢表型关联网络H1‑G‑M1;对高光谱指数和代谢物含量使用Lasso回归进行特征筛选,构建高光谱‑代谢表型关联网络H2‑M2;综合分析H1‑G‑M1和H2‑M2网络,整合二者构建高光谱表型‑基因型‑代谢物表型关联网络H3‑G‑M3,进一步挖掘作物籽粒代谢遗传结构的新信息。

    一种基因组特定区域的DNA测序方法

    公开(公告)号:CN109609612B

    公开(公告)日:2021-05-04

    申请号:CN201811606050.9

    申请日:2018-12-19

    IPC分类号: C12Q1/6869

    摘要: 本发明属于生物技术领域,具体为一种基因组特定区域的DNA测序方法。本发明根据参考基因组序列设计多重延伸引物,再以待测基因组序列为模板将延伸引物延长一个碱基,最终根据测定的延伸产物序列拼接待测区域的DNA序列。本发明能够发挥MassArray飞行质谱或SNaPshot等高通量基因型分析手段的优势,适用于精确测定已知基因组序列发生自然或人工突变后的DNA序列信息。此外,本发明提供的方法还可以应用于变化随机多样的基因编辑产物的序列测定中,该方法不仅可以定性地检测靶标区域是否发生了编辑,也可以对编辑后序列进行精确地测定,而且由于其多重分析的特点,使得对编辑后靶标区域基因型的分析更加高效精准。本发明相比传统的Sanger测序提高了测序工作的通量、精准度和速度,降低了成本。

    一种基因组特定区域的DNA测序方法

    公开(公告)号:CN109609612A

    公开(公告)日:2019-04-12

    申请号:CN201811606050.9

    申请日:2018-12-19

    IPC分类号: C12Q1/6869

    摘要: 本发明属于生物技术领域,具体为一种基因组特定区域的DNA测序方法。本发明根据参考基因组序列设计多重延伸引物,再以待测基因组序列为模板将延伸引物延长一个碱基,最终根据测定的延伸产物序列拼接待测区域的DNA序列。本发明能够发挥MassArray飞行质谱或SNaPshot等高通量基因型分析手段的优势,适用于精确测定已知基因组序列发生自然或人工突变后的DNA序列信息。此外,本发明提供的方法还可以应用于变化随机多样的基因编辑产物的序列测定中,该方法不仅可以定性地检测靶标区域是否发生了编辑,也可以对编辑后序列进行精确地测定,而且由于其多重分析的特点,使得对编辑后靶标区域基因型的分析更加高效精准。本发明相比传统的Sanger测序提高了测序工作的通量、精准度和速度,降低了成本。

    控制玉米叶宽基因ZmNL4及其应用

    公开(公告)号:CN108165554A

    公开(公告)日:2018-06-15

    申请号:CN201810108676.0

    申请日:2018-01-30

    发明人: 严建兵 王夏青

    摘要: 本发明属于分子遗传学领域。具体涉及控制玉米叶宽的基因ZmNL4及其相关的分子标记在筛选或改良植物叶宽性状方面的应用。本发明提供了一个控制玉米叶宽基因ZmNL4的序列,且公开了ZmNL4基因内部一个与玉米叶宽性状显著相关的InDel位点。本发明公开了基于该InDel位点开发的分子标记用于筛选玉米叶宽性状的方法。进一步地,本发明公开了通过基因工程手段突变ZmNL4蛋白或其同一性蛋白以降低植物叶宽的方法。