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公开(公告)号：CN109182588A
公开(公告)日：2019-01-11
申请号：CN201811291447.3
申请日：2018-10-31
申请人： 上海交通大学
IPC分类号： C12Q1/6895 , C12N15/11
CPC分类号： C12Q1/6895 , C12Q2600/13 , C12Q2600/156
摘要： 本发明涉及与黄瓜无限生长型基因共分离的分子标记Indel-de2。分子标记Indel-de2具有序列表SEQ ID NO.1中的1492个核苷酸序列片段，以及序列表SEQ ID NO.2中的189个核苷酸序列片段，其中SEQ ID NO.1中的核苷酸序列与无限生长型基因共分离，SEQ ID NO.2中的核苷酸序列与有限生长型基因共分离。该分析标记由ME3所示的上游引物和EM4所示的下游引物扩增得到。ME3:5’-CCTCTCGATCCCAACACCAC-3’，EM4：5’-CAGGCAGGCAAGTTTTGGAC-3’。该分子标记Indel-de2具有高稳定性，可以简便、快速、高通量地应用于世界各地黄瓜有限生长型/无限生长型类型的筛选。
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公开(公告)号：CN107513564A
公开(公告)日：2017-12-26
申请号：CN201710779750.7
申请日：2017-09-01
申请人： 上海交通大学
CPC分类号： C12Q1/6895 , C12Q2600/13 , C12Q2600/156
摘要： 本发明涉及一种与黄瓜果实软刺基因Ts共分离的分子标记及其应用。该分子标记命名为SSR-Ts1，分子标记由ME3所示的上游引物和EM4所示的下游引物组成。该分子标记具有序列表SEQ ID NO.1中的103个核苷酸序列片段，以及序列表SEQ ID NO.2中的101个核苷酸序列片段。其中SEQ ID NO.1中的核苷酸序列与软刺基因共分离，SEQ ID NO.2中的核苷酸序列与硬刺基因共分离。与现有技术相比，该分子标记具有高稳定性，可以简便、快速、高通量地应用于世界各地黄瓜硬刺/软刺类型的筛选。
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公开(公告)号：CN106868156A
公开(公告)日：2017-06-20
申请号：CN201710157379.0
申请日：2017-03-16
申请人： 上海交通大学
摘要： 本发明涉及一个与黄瓜ZYMV抗性基因共分离的新型InDel分子标记，命名为InDel‑zym2，由SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列片段和SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列片段组成；其中SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列片段与抗性基因共分离，SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列片段与感病基因共分离。本发明的InDel分子标记具有高稳定性，可以简便、快速、高通量的应用于黄瓜苗期ZYMV抗性单株的辅助筛选；根据SEQ ID NO.5与SEQ ID No.6所示，由插入/缺失突变造成的抗性候选基因DNA长度的差异，还可以设计多对共显性的InDel标记作为ZYMV抗性筛选的分子标记。本发明的InDel标记为ZYMV抗性的分子标记辅助育种奠定了基础，这将大大加快黄瓜ZYMV抗性分子育种的进程。
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公开(公告)号：CN105543218A
公开(公告)日：2016-05-04
申请号：CN201610043923.4
申请日：2016-01-22
申请人： 上海交通大学
CPC分类号： C12Q1/6895 , C12Q2600/13
摘要： 本发明提供了一个与控制黄瓜果刺有无基因Tril共分离的显性分子标记，命名为CoT-01，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，所述CoT-01与有果刺基因Tril连锁，无果刺基因tril不能扩增出特异性片段。本发明的分子标记和Tril基因位点共分离，对黄瓜微毛和无毛品系的区分有很大帮助；且具有高稳定性，可以在黄瓜苗期便可简便、快速地区分有无果刺表型，可应用于相关的分子标记辅助育种中。
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公开(公告)号：CN103074338B
公开(公告)日：2014-04-16
申请号：CN201310013138.0
申请日：2013-01-14
申请人： 上海交通大学
摘要： 本发明提供了用于筛选有瘤/无瘤黄瓜果实类型的显性分子标记Y68，该显性分子标记由序列表中SEQ ID NO.1所示的486个核苷酸组成，该序列位于果瘤基因Tu的启动子序列中，该显性分子标记具有高稳定性，有瘤黄瓜品种均含有该显性分子标记，无瘤品种均缺失SEQ ID NO.1所示的486个核苷酸，故此不含有该显性分子标记。故本发明中的显性分子标记Y68可以简便、快速、高通量地应用于世界各地黄瓜果实有瘤/无瘤类型的筛选。本发明还提供了控制果瘤性状的基因蛋白编码序列，由序列表中SEQ ID NO.4所示的213个氨基酸组成，是含有单锌指结构的C2H2型锌指蛋白的一个转录因子，研究该转录因子可以为黄瓜无毛基因(gl)的鉴定及进一步阐明黄瓜毛和瘤的形态建成机理打下坚实的基础。
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公开(公告)号：CN101250534B
公开(公告)日：2012-08-22
申请号：CN200810034855.0
申请日：2008-03-20
申请人： 上海交通大学
摘要： 本发明涉及的是一种基因工程技术领域的黄瓜TTG1-like基因的蛋白编码序列。包括：编码具有黄瓜TTG1-like蛋白质活性的多肽的核苷酸序列，而且该核苷酸序列具有SEQ ID NO.3中从核苷酸第160-1158位的核苷酸序列有70％的同源性；或者所述核苷酸序列能在45-55℃条件下与SEQ ID NO.3中从核苷酸第160-1158位的核苷酸序列杂交。在黄瓜中克隆与拟南芥决定表皮毛起始的TTG1同源的基因，不仅将有利于理解植物表皮毛形态建成的分子机制，而且也将会有助于认识黄瓜果刺这个重要品质基因形成的分子机理，为黄瓜品质育种提供理论依据，加快品种育种进程。本发明也对植物花色的改良有重要作用，本发明具有很大的应用价值。
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公开(公告)号：CN101240281B
公开(公告)日：2011-06-08
申请号：CN200810034529.X
申请日：2008-03-13
申请人： 上海交通大学
摘要： 本发明涉及的是一种基因工程技术领域的一种黄瓜侧枝抑制基因CLS的编码序列。所述的编码序列，包括编码具有黄瓜侧枝抑制蛋白活性的多肽的核苷酸序列，所述的核苷酸序列与SEQ ID NO.3中从核苷酸第491-1666位的核苷酸序列有至少70％的同源性。所述的编码序列，它的开放阅读框为自第491-1666共1175个碱基。本发明可以促进侧芽原基形成，用于粮食作物、花卉植物、经济作物、油料作物上，增加它们的侧枝数目，从而增加产量。
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公开(公告)号：CN101481737A
公开(公告)日：2009-07-15
申请号：CN200910045048.3
申请日：2009-01-08
申请人： 上海交通大学
摘要： 一种基因工程技术领域的与黄瓜果瘤基因Tu紧密连锁的分子标记。本发明先得到两个SRAP标记，其中标记ME6EM9具有序列表中SEQ ID No.1中的序列，标记ME2EM4具有序列表中SEQ ID No.3和SEQ ID No.4中的序列；将ME6EM9和ME2EM4转化成稳定的SCAR标记，分别为C_SC69和C_SC24。C_SC69为显性标记，扩增SEQ ID No.2中的218bp产物；C_SC24为共显性标记，有两个扩增产物分别为SEQ ID No.5中的514bp和SEQ ID No.6中的455bp产物。本发明的分子标记可用于黄瓜果瘤性状的辅助选择育种，加速黄瓜品种育种的进程。
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公开(公告)号：CN114381543A
公开(公告)日：2022-04-22
申请号：CN202111626941.2
申请日：2021-12-28
申请人： 上海交通大学
IPC分类号： C12Q1/6895 , C12N15/11
摘要： 本发明公开了一种检测黄瓜CsPsy1基因SNP位点的分子标记及其应用，属于植物生物技术和分子育种领域。通过比对不同黄瓜材料中CsPsy1基因序列发现CsPsy1基因起始密码子上游第27核苷酸处在不同材料间有一个单核苷酸差异，根据此处的核苷酸差异设计得到一个基于PCR和酶切技术的分子标记SNP‑CsPsy1，其由SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列片段和SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列片段组成，两者之间有一个T/C的单核苷酸差异。本发明中检测黄瓜CsPsy1基因SNP位点的分子标记具有高稳定性，可以快速、高通量的在黄瓜候选材料的任何阶段对CsPsy1基因的SNP位点进行检测，应用于黄瓜分子标记辅助育种实践。
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