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公开(公告)号：CN112430658A
公开(公告)日：2021-03-02
申请号：CN202011214917.3
申请日：2020-11-04
申请人： 上海交通大学医学院附属瑞金医院 , 苏州云泰生物医药科技有限公司
IPC分类号： C12Q1/6886 , C12Q1/6874 , C40B50/06
摘要： 本发明涉及基因突变检测领域，具体讲，涉及结内外周T细胞淋巴瘤相关基因检测试剂盒及建库方法。本发明的结内外周T细胞淋巴瘤相关基因的检测试剂盒包括针对76个目的基因捕获探针。本发明试剂盒采用液相捕获进行文库构建，具有文库构建、覆盖率高、比对率高、均一性好、操作简单等优点。
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公开(公告)号：CN112410424A
公开(公告)日：2021-02-26
申请号：CN202011214925.8
申请日：2020-11-04
申请人： 上海交通大学医学院附属瑞金医院 , 苏州云泰生物医药科技有限公司
IPC分类号： C12Q1/6886 , C12Q1/6806
摘要： 本发明涉及基因突变检测领域，具体讲，涉及NK/T细胞淋巴瘤相关基因检测试剂盒及建库方法。本发明的NK/T细胞淋巴瘤相关基因的检测试剂盒包括针对65个目的基因捕获探针。本发明试剂盒采用两轮PCR反应进行文库构建，具有文库构建周期短、覆盖率高、比对率高、均一性好、操作简单等优点。
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公开(公告)号：CN111863133B
公开(公告)日：2023-07-18
申请号：CN201911389652.8
申请日：2019-12-30
申请人： 上海交通大学医学院附属瑞金医院 , 苏州云泰生物医药科技有限公司
IPC分类号： G16B30/10
摘要： 本发明涉及基因信息数据处理领域，具体讲，涉及一种高通量测序数据的分析方法、试剂盒及分析系统。本发明开发了一种新的分析方法用于分析高通量测序数据中的部分串联重复，实现了对部分串联重复的快速、准确鉴定，并提高检测的灵敏度。
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公开(公告)号：CN111863133A
公开(公告)日：2020-10-30
申请号：CN201911389652.8
申请日：2019-12-30
申请人： 上海交通大学医学院附属瑞金医院 , 苏州云泰生物医药科技有限公司
IPC分类号： G16B30/10
摘要： 本发明涉及基因信息数据处理领域，具体讲，涉及一种高通量测序数据的分析方法、试剂盒及分析系统。本发明开发了一种新的分析方法用于分析高通量测序数据中的部分串联重复，实现了对部分串联重复的快速、准确鉴定，并提高检测的灵敏度。
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公开(公告)号：CN114277134A
公开(公告)日：2022-04-05
申请号：CN202111220611.3
申请日：2021-10-20
申请人： 上海交通大学医学院附属瑞金医院 , 上海源奇生物医药科技有限公司
IPC分类号： C12Q1/6886 , C12N15/11 , G16B20/50 , G16B20/20 , G16B25/20
摘要： 本发明涉及生物检测领域，具体涉及一种弥漫大B细胞淋巴瘤的分型方法、分型模型，还涉及一种用于对弥漫大B细胞淋巴瘤的靶向测序试剂盒和分型试剂盒。方法包括：获取最低样本量的弥漫大B细胞淋巴瘤样本；检测弥漫大B细胞淋巴瘤样本中18个相关基因的突变信息；将突变信息采用PAM算法聚类，建立分型模型，获得分出包含MCD型、N1型、EZB型、BN2型和Others型的分型模型。通过一致性的比较发现，应用NEJM50基因模型分出的结果和本发明的模型结果高度一致，本发明仅通过检测18个基因的突变信息即可完成分型，且测序成本较低、便于临床推广、降低了检测成本、经济实惠。
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公开(公告)号：CN111584001B
公开(公告)日：2022-05-20
申请号：CN202010090278.8
申请日：2020-02-13
申请人： 上海交通大学医学院附属瑞金医院 , 上海源奇生物医药科技有限公司
摘要： 本发明涉及基因突变检测领域，具体讲，涉及一种用于淋巴瘤预后判断的方法、试剂盒及应用。本发明通过数据分析计算IPI分型为中高危患者的预后风险值，协助区分高危与低危风险人群，能有效地区分出IPI分型无法确定的潜在不复发的患者，减少此类患者过度治疗的现象，从而降低患者的不良影响，有助于节省治疗成本，同时还能改善患者的生活条件。
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公开(公告)号：CN117253542A
公开(公告)日：2023-12-19
申请号：CN202311425722.7
申请日：2023-10-30
申请人： 上海交通大学医学院附属瑞金医院 , 上海睿昂基因科技股份有限公司
IPC分类号： G16B20/50 , C12Q1/6886
摘要： 本发明涉及生物诊断技术领域，尤其涉及一种用于肿瘤分子分型的突变基因集及其应用，所述突变基因集包括DNA甲基化修饰相关基因、组蛋白修饰相关基因、染色质重塑相关基因、TCR信号通路相关基因、PI3K‑AKT信号通路相关基因、JAK‑STAT信号通路相关基因、免疫逃逸相关基因、P53信号通路相关基因、肿瘤抑制基因、NOTCH信号通路相关基因在内的82个突变基因。本发明的突变基因集可以用于对结内外周T细胞淋巴瘤进行分子分型、靶向治疗及患者总体生存期预测，经临床试验验证，对所有初发、复发PTCL患者、基于基因组学分型的复发或难治性外周T细胞淋巴瘤伞形研究及对接受不同治疗方案的PTCL患者均适用，具有极广的应用范围。
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公开(公告)号：CN111584001A
公开(公告)日：2020-08-25
申请号：CN202010090278.8
申请日：2020-02-13
申请人： 上海交通大学医学院附属瑞金医院 , 上海源奇生物医药科技有限公司
摘要： 本发明涉及基因突变检测领域，具体讲，涉及一种用于淋巴瘤预后判断的方法、试剂盒及应用。本发明通过数据分析计算IPI分型为中高危患者的预后风险值，协助区分高危与低危风险人群，能有效地区分出IPI分型无法确定的潜在不复发的患者，减少此类患者过度治疗的现象，从而降低患者的不良影响，有助于节省治疗成本，同时还能改善患者的生活条件。
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公开(公告)号：CN114277134B
公开(公告)日：2024-05-28
申请号：CN202111220611.3
申请日：2021-10-20
申请人： 上海交通大学医学院附属瑞金医院 , 上海源奇生物医药科技有限公司
IPC分类号： C12Q1/6886 , C12N15/11 , G16B20/50 , G16B20/20 , G16B25/20
摘要： 本发明涉及生物检测领域，具体涉及一种弥漫大B细胞淋巴瘤的分型方法、分型模型，还涉及一种用于对弥漫大B细胞淋巴瘤的靶向测序试剂盒和分型试剂盒。方法包括：获取最低样本量的弥漫大B细胞淋巴瘤样本；检测弥漫大B细胞淋巴瘤样本中18个相关基因的突变信息；将突变信息采用PAM算法聚类，建立分型模型，获得分出包含MCD型、N1型、EZB型、BN2型和Others型的分型模型。通过一致性的比较发现，应用NEJM50基因模型分出的结果和本发明的模型结果高度一致，本发明仅通过检测18个基因的突变信息即可完成分型，且测序成本较低、便于临床推广、降低了检测成本、经济实惠。
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公开(公告)号：CN116884490A
公开(公告)日：2023-10-13
申请号：CN202310828992.6
申请日：2023-07-06
申请人： 上海交通大学医学院附属瑞金医院 , 上海源奇生物医药科技有限公司
IPC分类号： G16B25/20 , G16B20/50 , G06F18/23 , C12Q1/6886 , C40B50/06
摘要： 本发明涉及生物检测技术领域，尤其涉及一种检测弥漫大B细胞淋巴瘤的试剂盒及其应用。所述目的基因包括：BCL2基因、BCL6基因、MYC基因、ARID1A基因、B2M基因、BTG1基因、BTG2基因、CCND3基因、CD70基因、CD79B基因、CIITA基因、CREBBP基因、DDX3X基因、DTX1基因、DUSP2基因、EP300基因、EZH2基因、FAS基因、GNA13基因、IRF4基因、IRF8基因、KMT2D基因、MPEG1基因、MYD88基因、NOTCH1基因、NOTCH2基因、PIM1基因、PRDM1基因、SGK1基因、SOCS1基因、STAT3基因、STAT6基因、TBL1XR1基因、TET2基因、TNFAIP3基因、TNFRSF14基因、TP53基因、ZFP36L1基因。利用本发明的试剂盒检测弥漫大B细胞淋巴瘤的临床治疗结果可以提供预后判断和靶向药物预测作用，即实现一次检测同时进行分型诊断、预后判断和靶向药物预测，具有更全面的临床指导意义。
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