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公开(公告)号:CN101812510A
公开(公告)日:2010-08-25
申请号:CN200910201015.3
申请日:2009-12-11
Applicant: 上海市农业科学院
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种PSMA1基因中用于猪肉产品溯源的SNP分子标记,采用PCR--RFLP方法进行检测,通过DNApool测序获得。在包括11个猪品种或品系的试验群体中,分析该SNP分子标记在试验群体中等位基因的分布情况,发现该分子标记在不同的品种和品系中的等位基因频率接近,多态性丰富,品种或品系间等位基因频率分布差异小,初步判定该SNP标记可用作猪肉产品DNA溯源。
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公开(公告)号:CN101743830A
公开(公告)日:2010-06-23
申请号:CN200910201073.6
申请日:2009-12-14
Applicant: 上海市农业科学院
Abstract: 本发明公开了一种转基因青蒿在环境释放试验的田间设计和栽培管理方法,首先将青蒿种子种植于发苗培养基中发苗,然后将青蒿苗移栽于环境释放试验大田中,通过田间设计、合理灌溉、施肥、除草以及病虫害管理,为青蒿的生长提供合适环境条件,并采用随机区组方式种植转基因青蒿和非转基因青蒿材料,测定其基本农艺性状以及目的基因的表达情况。本发明为转基因青蒿未来的商业化生产提供了一定技术支持,并对对转基因药用植物的环境安全评价和未来转基因青蒿的大规模商业化种植具有重要意义。
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公开(公告)号:CN101717820A
公开(公告)日:2010-06-02
申请号:CN200910200686.8
申请日:2009-12-24
Applicant: 上海市农业科学院
Abstract: 本发明涉及TRIM55基因中一种用于猪肉产品DNA溯源的新SNP标记。所述SNP标记是通过在13个猪品种或品系的试验群体中,分析其TRIM55基因的SNP位点等位基因的分布情况,进一步筛选而获得。所述TRIM55基因长783bp,其中包含完整的外显子1和内含子1的序列,部分外显子2的序列,其序列如SEQ ID NO 1所示,在其第547位碱基处有一个碱基突变547C-547T,检测该碱基突变的正、反向引物的DNA序列如SEQ ID NO 2和SEQ ID NO 3所示。本发明的新SNP标记可广泛应用于猪肉产品的安全性溯源中。
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公开(公告)号:CN101712993A
公开(公告)日:2010-05-26
申请号:CN200910200680.0
申请日:2009-12-24
Applicant: 上海市农业科学院
Abstract: 本发明公开了PSMA6基因中一个用于猪肉产品DNA溯源的新SNP分子标记。在6个猪品种或品系的试验群体(共计145个个体)中,通过克隆测序、序列分析比较,分析其PSMA6基因的SNP位点等位基因的分布情况,进一步筛选获得本发明的用于猪肉产品DNA溯源的新SNP分子标记。所述PSMA6基因长628bp,其中包含完整的内含子2、内含子3和完整外显子2的序列,部分外显子1和部分外显子3的序列。其序列如SEQ ID NO 1所示,在其第21位碱基处有一个碱基突变21C-21T。本发明的新SNP分子标记可应用于猪肉产品的安全件溯源。
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公开(公告)号:CN102382900B
公开(公告)日:2013-05-08
申请号:CN201010271159.9
申请日:2010-08-31
Applicant: 上海市农业科学院
Abstract: 本发明公开了一种猪圆环病毒2型实时荧光定量PCR检测方法,包括以下步骤:1)首先设计并合成特异性引物和探针;2)目的片段的获得:配制PCR反应体系,按照PCR反应程序进行反应得到目的片段;3)配制连接反应液;4)转化并提取质粒模板;5)定性PCR检测;6)定量PCR检测。本发明的检测方法简单、快速、灵敏度高、特性性强、重复性好,并且检测的定量极限和检测极限极低,灵敏度高,可准确定量检测出猪圆环病毒2型,达到预防和控制猪圆环病毒2型流行的作用。
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公开(公告)号:CN102477424A
公开(公告)日:2012-05-30
申请号:CN201010555545.0
申请日:2010-11-23
Applicant: 上海市农业科学院
Abstract: 本发明涉及一种猪SFTPC基因中一个可用于溯源的SNP分子标记及其检测方法。所述的SNP分子标记是通过DNA池(pool)测序获得,其序列如SEQ ID NO 1所示,在该SNP分子标记的第639位碱基处有一个碱基突变639A→639T,其编码的氨基酸序列如SEQ ID NO 2所示。在包括11个猪品种或品系的试验群体中,分析该SNP分子标记在试验群体中等位基因的分布情况,发现该分子标记在不同的品种或品系中的等位基因频率接近,多态性丰富,品种或品系间等位基因频率分布差异小,并且杂合度都大于0.3,初步判定该SNP标记可用作猪肉产品DNA溯源。
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公开(公告)号:CN101717821A
公开(公告)日:2010-06-02
申请号:CN200910200687.2
申请日:2009-12-24
Applicant: 上海市农业科学院
Abstract: 本发明公开了MMP3基因中一个用于猪肉产品DNA溯源的新SNP分子标记,它是通过在6个猪品种或品系的试验群体(共计190个体)中,分析其MMP3基因的SNP位点等位基因的分布情况,通过克隆测序、序列分析比较而获得。所述MMP3基因序列长573bp,其中包含完整的内含子2、内含子3和完整外显子2的序列,部分外显子1和部分外显子3的序列;其序列如SEQ ID NO 1所示,在其第182位碱基处有一个碱基突变182C-182T。通过在试验群体中等位基因的变异度分析,初步判定本发明的SNP分子标记可用于猪肉产品溯源。
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公开(公告)号:CN101717770A
公开(公告)日:2010-06-02
申请号:CN200910200681.5
申请日:2009-12-24
Applicant: 上海市农业科学院
Abstract: 本发明公开一种提取苏云金芽胞杆菌大质粒DNA的方法,包括以下步骤:1)菌体的培养与收集;2)原生体的制备;3)细胞的裂解和质粒的提取;4)质粒的纯化。应用该方法得到的质粒DNA可直接用来限制性内切酶消化、PCR扩增等多种分子生物学实验。本发明操作简便、安全、质量高,可同时适用于多种革兰氏阳性细菌质粒DNA的提取,因此具有广泛的适用性。
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公开(公告)号:CN101712953A
公开(公告)日:2010-05-26
申请号:CN200910200684.9
申请日:2009-12-24
Applicant: 上海市农业科学院
Abstract: 本发明公开了一种用于评价动物肠道微生物群落多样性的DNA提取方法。在细胞裂解以前先对样品进行前处理,将胞外DNA及污染物进行去除,避免了纯化步骤存在污染物去除困难和DNA回收率低的问题。本发明提取过程不使用酚、氯仿,减少了对实验人员的身体健康伤害、所获DNA完整,分子片段大于10kb,产量高。所提取的肠道微生物DNA的OD260/OD230及OD260/OD280接近标准值,可直接应用于分子操作,以评价动物肠道微生物群落多样性。
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公开(公告)号:CN101712953B
公开(公告)日:2012-06-20
申请号:CN200910200684.9
申请日:2009-12-24
Applicant: 上海市农业科学院
Abstract: 本发明公开了一种用于评价动物肠道微生物群落多样性的DNA提取方法。在细胞裂解以前先对样品进行前处理,将胞外DNA及污染物进行去除,避免了纯化步骤存在污染物去除困难和DNA回收率低的问题。本发明提取过程不使用酚、氯仿,减少了对实验人员的身体健康伤害、所获DNA完整,分子片段大于10kb,产量高。所提取的肠道微生物DNA的OD260/OD230及OD260/OD280接近标准值,可直接应用于分子操作,以评价动物肠道微生物群落多样性。
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