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公开(公告)号：CN104156636A
公开(公告)日：2014-11-19
申请号：CN201410368238.X
申请日：2014-07-30
Applicant: 中南大学
IPC: G06F19/22
Abstract: 本发明公开了一种基于后缀数组的模糊串联重复序列识别方法，将得到的DNA碱基序列以字符串形式输入计算机中；基于字典排序算法对基因序列进行处理，生成相应的后缀数组；基于后缀数组得到最大公共前缀列；基于精确串联重复识别算法得到序列的最大串联重复；基于改进的FFT变换得到序列的最优偏移量；基于动态规划算法对序列进行比对；基于模糊串联重复识别算法得到序列的模糊串联重复。本发明能快速识别与准确分析基因组中的重复序列，找出序列的模糊串联重复。
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