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公开(公告)号:CN108877953A
公开(公告)日:2018-11-23
申请号:CN201810573400.X
申请日:2018-06-06
Applicant: 中南大学
IPC: G16H70/40
Abstract: 本发明公开了一种基于多相似性网络的药物敏感性预测方法,首先利用药物的结构信息构建药物相似性网络,利用细胞系基因表达谱数据在进行基因筛选后构建细胞系相似性网络,根据蛋白质结构信息计算基因相似性网络。在此基础上,建立药物、细胞系和基因之间的关联关系,在构建的药物相似性网络、细胞系相似性网络和基因相似性网络构成的多网络中进行三随机游走来预测药物的敏感性。本发明在简单实用的基础上,能够很好的提高药物敏感性识别准确率,为研究人员进行药物设计提供重要参考。
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公开(公告)号:CN108877953B
公开(公告)日:2021-09-03
申请号:CN201810573400.X
申请日:2018-06-06
Applicant: 中南大学
IPC: G16H70/40
Abstract: 本发明公开了一种基于多相似性网络的药物敏感性预测方法,首先利用药物的结构信息构建药物相似性网络,利用细胞系基因表达谱数据在进行基因筛选后构建细胞系相似性网络,根据蛋白质结构信息计算基因相似性网络。在此基础上,建立药物、细胞系和基因之间的关联关系,在构建的药物相似性网络、细胞系相似性网络和基因相似性网络构成的多网络中进行三随机游走来预测药物的敏感性。本发明在简单实用的基础上,能够很好的提高药物敏感性识别准确率,为研究人员进行药物设计提供重要参考。
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公开(公告)号:CN108830040B
公开(公告)日:2021-06-15
申请号:CN201810578523.2
申请日:2018-06-07
Applicant: 中南大学
Abstract: 本发明公开了一种基于细胞系和药物相似性网络的药物敏感性预测方法,包括:构建药物相似性网络、细胞系相似性网络以及药物‑细胞系关系网络;分别依据药物相似性网络、细胞系相似性网络、药物‑细胞系关系网络获取对应的药物邻接矩阵、细胞系邻接矩阵、药物‑细胞系关系初矩阵;基于药物邻接矩阵、细胞系邻接矩阵、药物‑细胞系关系初矩阵采用不平衡的双随机游走算法得到药物‑细胞系的药物敏感性预测矩阵,其中,采用不平衡的双随机游走公式游走完成后得到的药物‑细胞系的药物敏感性预测矩阵中各个元素为相对应药物对细胞系预测的敏感性数值。本发明充分考虑药物相似性网络和细胞系相似性网络的特性,进而提高了药物敏感性预测结果的可靠性。
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公开(公告)号:CN108830040A
公开(公告)日:2018-11-16
申请号:CN201810578523.2
申请日:2018-06-07
Applicant: 中南大学
Abstract: 本发明公开了一种基于细胞系和药物相似性网络的药物敏感性预测方法,包括:构建药物相似性网络、细胞系相似性网络以及药物-细胞系关系网络;分别依据药物相似性网络、细胞系相似性网络、药物-细胞系关系网络获取对应的药物邻接矩阵、细胞系邻接矩阵、药物-细胞系关系初矩阵;基于药物邻接矩阵、细胞系邻接矩阵、药物-细胞系关系初矩阵采用不平衡的双随机游走算法得到药物-细胞系的药物敏感性预测矩阵,其中,采用不平衡的双随机游走公式游走完成后得到的药物-细胞系的药物敏感性预测矩阵中各个元素为相对应药物对细胞系预测的敏感性数值。本发明充分考虑药物相似性网络和细胞系相似性网络的特性,进而提高了药物敏感性预测结果的可靠性。
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