生物基因组简单重复序列的发掘方法及设备

    公开(公告)号:CN102495977A

    公开(公告)日:2012-06-13

    申请号:CN201110414015.9

    申请日:2011-12-13

    Abstract: 本发明公开了一种生物基因组简单重复序列的发掘方法,其特征在于,包括以下步骤:根据需要发掘的生物基因组简单重复序列SSR的特征构建正则表达式;通过所述正则表达式分析待分析序列,判断所述待分析序列中是否存在符合所述正则表达式要求的目标SSR,如果判断结果为是,则输出所述目标SSR;如果判断结果为否,则显示所述待分析序列中不存在所述目标SSR的信息。因此,本发明提供的生物基因组简单重复序列的发掘方法及设备,在对SSR发掘过程中,不会产生冗余结果,从而降低了SSR发掘过程的配置复杂度,提高了SSR发掘的效率,降低了SSR发掘软件的开发难度。

    生物基因组简单重复序列的发掘方法及设备

    公开(公告)号:CN102495977B

    公开(公告)日:2015-05-27

    申请号:CN201110414015.9

    申请日:2011-12-13

    Abstract: 本发明公开了一种生物基因组简单重复序列的发掘方法,其特征在于,包括以下步骤:根据需要发掘的生物基因组简单重复序列SSR的特征构建正则表达式;通过所述正则表达式分析待分析序列,判断所述待分析序列中是否存在符合所述正则表达式要求的目标SSR,如果判断结果为是,则输出所述目标SSR;如果判断结果为否,则显示所述待分析序列中不存在所述目标SSR的信息。因此,本发明提供的生物基因组简单重复序列的发掘方法及设备,在对SSR发掘过程中,不会产生冗余结果,从而降低了SSR发掘过程的配置复杂度,提高了SSR发掘的效率,降低了SSR发掘软件的开发难度。

    烟草普通花叶病毒环介导等温扩增检测方法

    公开(公告)号:CN101899530B

    公开(公告)日:2013-02-06

    申请号:CN200910229910.6

    申请日:2009-11-05

    Abstract: 本发明提供一种烟草普通花叶病毒环介导等温扩增检测方法,包括步骤1):提供两对用于检测烟草普通花叶病毒的LAMP引物序列,即长度分别为45bp、44bp、20bp和20bp的寡聚核苷酸序列,上游引物1、下游引物1、上游引物2和下游引物2,上述两对LAMP引物的寡聚核苷酸序列如下:上游引物1:5’-GCACCACGTGTGATTACGGACATTTTGACCTCTGGTCCTGCAACT-3’,下游引物1:5’-AAGGGTTGTGTCTTGGATCGCGTTTTTTACGTGCCTGCGGATGT-3’,上游引物2:5’-CGAGAGCTCTTCTGGTTTGG-3’,下游引物2:5’-GATTCGAACCCCTCGCTTTA-3’,还包括步骤2):提供一种烟草普通花叶病毒的LAMP检测方法,即首先从待检测样品中制备反应模板,并配制LAMP反应体系,然后通过LAMP反应程序对反应模板进行扩增,最后根据反应混合物的颜色显示对检测结果进行判断。

    烟草普通花叶病毒环介导等温扩增检测方法

    公开(公告)号:CN101899530A

    公开(公告)日:2010-12-01

    申请号:CN200910229910.6

    申请日:2009-11-05

    Abstract: 本发明提供一种烟草普通花叶病毒环介导等温扩增检测方法,包括步骤1):提供两对用于检测烟草普通花叶病毒的LAMP引物序列,即长度分别为45bp、44bp、20bp和20bp的寡聚核苷酸序列,上游引物1、下游引物1、上游引物2和下游引物2,上述两对LAMP引物的寡聚核苷酸序列如下:上游引物1:5’-GCACCACGTGTGATTACGGACATTTTGACCTCTGGTCCTGCAACT-3’下游引物1:5’-AAGGGTTGTGTCTTGGATCGCGTTTTTTACGTGCCTGCGGATGT-3’上游引物2:5’-CGAGAGCTCTTCTGGTTTGG-3’下游引物2:5’-GATTCGAACCCCTCGCTTTA-3’还包括步骤2):提供一种烟草普通花叶病毒的LAMP检测方法,即首先从待检测样品中制备反应模板,并配制LAMP反应体系,然后通过LAMP反应程序对反应模板进行扩增,最后根据反应混合物的颜色显示对检测结果进行判断。

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