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公开(公告)号:CN103993081B
公开(公告)日:2015-11-04
申请号:CN201410209290.0
申请日:2014-05-16
申请人: 中国水产科学研究院珠江水产研究所 , 佛山市南海百容水产良种有限公司
IPC分类号: C12Q1/68
摘要: 本发明一种鉴别雌核发育草鱼与普通草鱼的方法,提供一种具有多态性高、遗传稳定、检测成功率高、便于广泛使用等优点的分子标记方法,能够快速准确地鉴别雌核发育草鱼与普通草鱼。根据遗传纯合度的差异,从14个SSR标记中筛选出了5个在雌核发育群体与野生群体中扩增稳定、条带清晰、多态性和遗传纯合度差异较大SSR。由于雌核发育群体中遗传纯合度大大提高,SSR在其体内扩增的等位基因数目也会减少。统计分析发现,这5个SSR在普通草鱼体内扩增的实际等位基因数目为8-10个,而在雌核发育草鱼体内扩增的等位基因数目为5-7个,通过比较等位基因数即可鉴别雌核发育草鱼与普通草鱼,其准确率的理论值可达99.92%。
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公开(公告)号:CN103993081A
公开(公告)日:2014-08-20
申请号:CN201410209290.0
申请日:2014-05-16
申请人: 中国水产科学研究院珠江水产研究所 , 佛山市南海百容水产良种有限公司
IPC分类号: C12Q1/68
CPC分类号: C12Q1/6888 , C12Q2600/156
摘要: 本发明一种鉴别雌核发育草鱼与普通草鱼的方法,提供一种具有多态性高、遗传稳定、检测成功率高、便于广泛使用等优点的分子标记方法,能够快速准确地鉴别雌核发育草鱼与普通草鱼。根据遗传纯合度的差异,从14个SSR标记中筛选出了5个在雌核发育群体与野生群体中扩增稳定、条带清晰、多态性和遗传纯合度差异较大SSR。由于雌核发育群体中遗传纯合度大大提高,SSR在其体内扩增的等位基因数目也会减少。统计分析发现,这5个SSR在普通草鱼体内扩增的实际等位基因数目为8-10个,而在雌核发育草鱼体内扩增的等位基因数目为5-7个,通过比较等位基因数即可鉴别雌核发育草鱼与普通草鱼,其准确率的理论值可达99.92%。
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公开(公告)号:CN112575094B
公开(公告)日:2022-11-08
申请号:CN202011506211.4
申请日:2020-12-18
申请人: 中国水产科学研究院珠江水产研究所 , 广东梁氏水产种业有限公司
IPC分类号: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
摘要: 本发明公开了一种用于鉴定大口黑鲈北方亚种、佛罗里达亚种及其杂交种的InDel标记及其应用,其中,该InDel分子标记为在大口黑鲈北方亚种20号染色体第8035398~8035480位,具有长度为82bp的插入/缺失核苷酸序列。本发明中的InDel分子标记可以同时对大口黑鲈北方亚种、佛罗里达亚种及其杂交种进行鉴定,与常规只能鉴定大口黑鲈北方亚种和佛罗里达亚种的SNP标记相比,适用范围更广,实用性更好,而且不受大口黑鲈发育时期和环境因素的影响,鉴定结果准确率高。
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公开(公告)号:CN110041422B
公开(公告)日:2022-07-19
申请号:CN201810037972.6
申请日:2018-01-16
申请人: 中国水产科学研究院珠江水产研究所
IPC分类号: C07K14/46
摘要: 本发明公开了大口黑鲈生长相关的SNP位点及其应用,所述生长相关的SNP位点位于HSC70‑1基因序列第821、2804位碱基。本发明发现在HSC70‑1的C+821G位置存在等位基因C和等位基因G,组成三种基因型CC、GC和GG,在A+2804T位置存在等位基因A和等位基因T,组成三种基因型AA、AT和TT。当第821和2804碱基位置基因型为CC和TT的个体的生长性状明显优于其他基因型的个体。利用该现象将生产中保留CC和TT基因型的大口黑鲈亲本,去除其他基因型的个体,便可快速获得生长速度快且遗传稳定的大口黑鲈品种,即本发明SNP位点可应用于快速生长大口黑鲈亲本的筛选。
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公开(公告)号:CN107034307A
公开(公告)日:2017-08-11
申请号:CN201710478727.4
申请日:2017-06-22
申请人: 中国水产科学研究院珠江水产研究所
摘要: 本发明涉及一种SNP标记,尤其涉及一种与大口黑鲈生长性状相关的SNP标记及其应用,所述SNP标记是位于SEQ ID NO.1序列2533bp处的碱基多态位点。本发明创造性地提供了一种与大口黑鲈的生长性状相关的SNP标记,不同的SNP标记对应的基因型与大口黑鲈的生长性状的相关性已经得到证实,在此基础上,利用该SNP标记,可以进行大口黑鲈的筛选或检测,或大口黑鲈的人工养殖过程中易于驯食人工配合饲料的大口黑鲈或其亲本的筛选或检测,在大口黑鲈的养殖或选育领域,都具有积极的效果,及在此基础上,开发了一系列的引物对、方法及相应试剂盒,具有很大的科学价值和商业价值。
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公开(公告)号:CN105505927A
公开(公告)日:2016-04-20
申请号:CN201610063828.0
申请日:2016-01-29
申请人: 中国水产科学研究院珠江水产研究所
CPC分类号: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12Q2600/156 , C12Q2521/301
摘要: 本发明提供一种草鱼耐糖性能相关的SNP标记及其应用,包括两个SNP位点H3和H4,所述H3位于SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列中自5′端起第1817位,且该位置处碱基为T或C;所述H4位于SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列中自5′端起第1818位,且该位置处碱基为G或T。本发明的SNP标记与草鱼耐糖性能密切相关,能够有效用于鉴定或选育耐高糖的草鱼品种。
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公开(公告)号:CN101906477A
公开(公告)日:2010-12-08
申请号:CN201010243529.8
申请日:2010-08-03
申请人: 中国水产科学研究院珠江水产研究所
IPC分类号: C12Q1/68
摘要: 转红色荧光蛋白基因唐鱼聚合酶链式反应(PCR)检测方法,涉及对转红色荧光蛋白基因唐鱼特异的检测方法。根据外源的红色荧光蛋白基因序列设计了一对特异性扩增红色荧光蛋白基因的引物,经过优化反应体系和反应条件,认为退火温度64℃为最适的退火温度,以转红色荧光蛋白基因唐鱼基因组DNA为模板扩增出一条487bp的片段,以野生型唐鱼基因组DNA为模板进行扩增,没有扩增产物。本检测方法可早期鉴定转红色荧光蛋白基因唐鱼,甚至小鱼在出苗前就可以进行检测;检测速度快;在检测时可以设阳性对照(以含有红色荧光蛋白基因的质粒pDsRed-mylz2为PCR模板)和阴性对照(以水为模板),所以检测结果十分准确,成本低。
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公开(公告)号:CN113957155B
公开(公告)日:2023-06-13
申请号:CN202111269404.7
申请日:2018-12-30
申请人: 中国水产科学研究院珠江水产研究所
IPC分类号: C12Q1/6888 , C12Q1/6869 , C12N15/11
摘要: 本申请是201811648716.7的分案申请。本申请属于分子生物学DNA标记技术与应用领域,公开了与草鱼生长状况有关的SNP位点位于基因SNP35第410位碱基;当基因SNP35第410位碱基为CC基因型,体重显然优于TT基因型个体。本发明能够有效用于草鱼的分子标记辅助育种,挑选合适的基因型草鱼亲本进行繁殖,可以获得生长较快的草鱼鱼苗,加快草鱼育种进程。
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公开(公告)号:CN111378765B
公开(公告)日:2022-06-17
申请号:CN202010324033.7
申请日:2020-04-22
申请人: 中国水产科学研究院珠江水产研究所
IPC分类号: C12Q1/6888 , C12N15/11
摘要: 本发明公开了一种速生草鱼个体的分子标记及其检测方法。本发明公开了与草鱼快速生长调控有关的SNP标记。若该SNP标记位点是AA基因型,则为快速生长的草鱼;否则为缓慢生长的草鱼。应用该SNP标记及检测方法,在生产中筛选到AA基因型草鱼个体,用作草鱼亲本进行繁殖,可生产出具有生长优势的草鱼苗种。而且本发明中的方法操作简单、检测快速、检测成本低,便于广泛推广使用。
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公开(公告)号:CN113667761B
公开(公告)日:2022-06-03
申请号:CN202110948917.4
申请日:2021-08-18
申请人: 中国水产科学研究院珠江水产研究所
IPC分类号: C12Q1/6888 , C12N15/11
摘要: 本发明公开了一种草鱼胰岛素受体α亚型SNP分子标记组合及其应用,所述草鱼胰岛素受体α亚型分子标记组合涵盖在草鱼胰岛素受体α亚型的基因组中,并通过一般线性模型分析得出了其与草鱼生长性状的关系。而且,发明人还发现,利用其构建的H4双倍型在体重、体长、体高和体宽上显著高于其它基因型个体(P
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