猪5号染色体上与窝产仔数相关的SNP位点

    公开(公告)号:CN105543359B

    公开(公告)日:2019-05-31

    申请号:CN201610003456.2

    申请日:2016-01-04

    Abstract: 本发明涉及与猪产仔数性状相关的SNP位点,具体涉及猪5号染色体上一个与窝产仔数相关的SNP位点及其引物,属生物技术领域。该SNP位点为基因组版本NCBI Build Sscrofa 10.2的Chr5:9008762;该位点的等位基因为T和C,有C/C、T/C和T/T三种基因型,扩增该位点的引物及延伸引物为:Chr5‑PCRU:5’‑AGG TCT CCT GGG GAG CTT‑3’;Chr5‑PCRL:5’‑GGG CTC GAC CCT GTG ATC‑3’;Chr5‑SNPU:5’‑GAA AAG CTT CAC AGG CCA AGA ATA T‑3’。带有T/C基因型的猪产仔数高于T/T基因型,C为提高猪产仔数的有益等位基因并且T/C杂合猪产仔数最高。本发明的有益效果在于:全基因组重测序方法能够快速、批量地筛选与性状相关的SNP位点或基因,基因组版本NCBI Build Sscrofa 10.2的Chr5:9008762这个SNP位点能够作为遗传标记用于猪的遗传育种提高母猪的产仔数。

    猪5号染色体上与窝产仔数相关的SNP位点

    公开(公告)号:CN105543359A

    公开(公告)日:2016-05-04

    申请号:CN201610003456.2

    申请日:2016-01-04

    CPC classification number: C12Q1/6888 C12Q2600/124 C12Q2600/156

    Abstract: 本发明涉及与猪产仔数性状相关的SNP位点,具体涉及猪5号染色体上一个与窝产仔数相关的SNP位点及其引物,属生物技术领域。该SNP位点为基因组版本NCBI Build Sscrofa 10.2的Chr5:9008762;该位点的等位基因为T和C,有C/C、T/C和T/T三种基因型,扩增该位点的引物及延伸引物为:Chr5-PCRU:5’-AGG TCT CCT GGG GAG CTT-3’;Chr5-PCRL:5’-GGG CTC GAC CCT GTG ATC-3’;Chr5-SNPU:5’-GAA AAG CTT CAC AGG CCA AGA ATA T-3’。带有T/C基因型的猪产仔数高于T/T基因型,C为提高猪产仔数的有益等位基因并且T/C杂合猪产仔数最高。本发明的有益效果在于:全基因组重测序方法能够快速、批量地筛选与性状相关的SNP位点或基因,基因组版本NCBI Build Sscrofa 10.2的Chr5:9008762这个SNP位点能够作为遗传标记用于猪的遗传育种提高母猪的产仔数。

    猪5号染色体上一个与产仔数相关的分子标记及其引物

    公开(公告)号:CN103757011A

    公开(公告)日:2014-04-30

    申请号:CN201310729511.2

    申请日:2013-12-26

    Abstract: 本发明涉及与猪产仔数性状相关的分子标记,具体涉及猪5号染色体上一个与产仔数相关的分子标记及其引物,属生物技术领域。该分子标记位点为基因组版本NCBI?Build?Sscrofa10.2的Chr5:32275545;该位点的等位基因为T和C,有C/C、T/C和T/T三种基因型,该位点及其侧翼序列如SEQ?ID?NO:1所示。扩增权利要求1所述分子标记位点的引物及延伸引物为:Chr5-PCRU:5’-TGC?TGA?AGA?GAG?GAT?TTC?ACA-3’;Chr5-PCRL:5’-AAG?AAG?ATG?CTT?CAC?TAC?CAG?C-3’;Chr5-SNPU:5’-CTG?ACT?GAC?TAA?GGG?TAT?GTG?GAG?CTA?AGA?CAC?AT-3’。带有T/T基因型的猪产仔数高于T/C和C/C基因型。本发明的有益效果在于:运用全基因组重测序方法,能够快速、批量地筛选与性状相关的分子标记或候选基因,Chr5:32275545这个位点能够作为遗传标记用于猪的遗传育种提高母猪的产仔数。

    猪6号染色体上一个与产仔数相关的分子标记及其引物

    公开(公告)号:CN103757008A

    公开(公告)日:2014-04-30

    申请号:CN201310728457.X

    申请日:2013-12-26

    Abstract: 本发明涉及与猪产仔数性状相关的分子标记,具体涉及猪6号染色体上一个与产仔数相关的分子标记及其引物,属生物技术领域。该分子标记位点为基因组版本NCBI?Build?Sscrofa10.2的Chr6:69081465;该位点的等位基因为T和C,有C/C、T/C和T/T三种基因型,该位点及其侧翼序列如SEQ?ID?NO:1所示。扩增该分子标记位点的引物及延伸引物为:Chr6-PCRU:5’-ATT?TAC?CAG?AAA?ACA?CCC?AGG-3’;Chr6-PCRL:5’-TTT?TCA?TCA?TCC?CTT?CTA?ATC?TTC-3’;Chr6-SNPU:5’-ACT?GAC?TGA?CTG?ACT?AAA?AGT?ATT?TCA?GTG?GCA?GCG?AGA?G-3’。带有T/T基因型的猪产仔数高于T/C和C/C基因型。本发明的有益效果在于:运用全基因组重测序方法,能够快速、批量地筛选与性状相关的分子标记或候选基因,Chr6:69081465这个位点能够作为遗传标记用于猪的遗传育种提高母猪的产仔数。

    猪10号染色体上一个与产仔数相关的分子标记及其引物

    公开(公告)号:CN103757004A

    公开(公告)日:2014-04-30

    申请号:CN201310727912.4

    申请日:2013-12-26

    Abstract: 本发明涉及与猪产仔数性状相关的分子标记,具体涉及猪10号染色体上一个与产仔数相关的分子标记及其引物,属生物技术领域。该分子标记位点为基因组版本NCBI?Build?Sscrofa?10.2的Chr10:16018894;该位点的等位基因为T和C,有C/C、T/C和T/T三种基因型,该位点及其侧翼序列如SEQ?ID?NO:1所示。扩增该分子标记位点的引物及延伸引物为:Chr10-PCRU:5’-TGC?CAA?ACC?TGT?GTC?ACC-3’;Chr10-PCRL:5’-GGC?TGG?AGA?GGA?AAA?GGG-3’;Chr10-SNPU:5’-TGA?CTA?GAA?GCA?GCC?ATG?GGG?CCC?TGC?AGA-3’。带有T/T基因型的猪产仔数高于T/C和C/C基因型。本发明的有益效果在于:运用全基因组重测序方法,能够快速、批量地筛选与性状相关的分子标记或候选基因,Chr10:16018894这个位点能够作为遗传标记用于猪的遗传育提高母猪的产仔数。

    猪4号染色体上与窝产仔数相关的SNP位点及其引物

    公开(公告)号:CN105567817A

    公开(公告)日:2016-05-11

    申请号:CN201610003324.X

    申请日:2016-01-04

    CPC classification number: C12Q1/6888 C12Q2600/124 C12Q2600/156

    Abstract: 本发明涉及与猪产仔数性状相关的SNP位点,具体涉及猪4号染色体上一个与窝产仔数相关的SNP位点及其引物,属生物技术领域。该SNP位点为基因组版本NCBI Build Sscrofa 10.2的Chr4:37340666;该位点的等位基因为T和C,有C/C、T/C和T/T三种基因型,扩增该位点的引物及延伸引物为:Chr4-1-PCRU:5’-TGG ACA GGG TCT CAC AAT T-3’;Chr4-1-PCRL:5’-TTC TGC AAT CTC TCC TGA ATT C-3’;Chr4-1-SNPU:5’-CTG ACT GAC TTG GGT CTT CAG GAA ATT GCC CCC AA-3’。带有T/C基因型的猪产仔数高于T/T基因型,C为提高猪产仔数的有益等位基因并且T/C杂合猪产仔数最高。本发明的有益效果在于:全基因组重测序方法能够快速、批量地筛选与性状相关的SNP位点或基因,基因组版本NCBI Build Sscrofa 10.2的Chr4:37340666这个SNP位点能够作为遗传标记用于猪的遗传育种提高母猪的产仔数。

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