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公开(公告)号:CN119372333A
公开(公告)日:2025-01-28
申请号:CN202411639249.7
申请日:2024-11-15
Applicant: 中国科学院昆明动物研究所 , 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种与猪生长性状相关的SNP分子标记及其应用,所述SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,所述SNP分子标记位于猪参考基因组Sscrofa11.1版本第7号染色体第30318006bp处,所述SNP分子标记位于对应SEQ ID NO:1第60bp处,该处的碱基从G突变为A;所述SNP分子标记的基因型为AA的个体具有高生长遗传性状;所述SNP分子标记的基因型为GG或AG的个体具有低生长遗传性状;在育种时通过保留所述SNP分子标记基因型为AA的个体,淘汰基因型为GG或AG的个体来提高后代猪的生长性能。
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公开(公告)号:CN119220708A
公开(公告)日:2024-12-31
申请号:CN202411638834.5
申请日:2024-11-15
Applicant: 中国科学院昆明动物研究所 , 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种与猪肉品质性状相关的SNP分子标记及其应用,所述SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,所述SNP分子标记位于猪参考基因组Sscrofa11.1版本第12号染色体第54801192‑54801193bp处,所述SNP分子标记位于对应SEQ ID NO:1第61‑62bp处,碱基从GT突变为AC;所述SNP分子标记的基因型为AC/AC的个体具有高猪肉品质性状;所述SNP分子标记的基因型为GT/GT或GT/AC的个体具有低猪肉品质性状;在育种时通过保留所述SNP分子标记基因型为AC/AC的个体,淘汰基因型为GT/GT或GT/AC的个体来提高后代猪的猪肉品质。
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公开(公告)号:CN119339787A
公开(公告)日:2025-01-21
申请号:CN202411338512.9
申请日:2024-09-24
Applicant: 中国科学院昆明动物研究所 , 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
IPC: G16B20/20 , C12Q1/6879 , C12Q1/6888 , C12Q1/6869 , G16B20/30 , G16B40/00 , G06N5/04
Abstract: 本发明涉及一种识别猪常染色体上性别拮抗热点区域的方法及应用。本发明提供的方法,包括以下具体步骤:构建家猪杂交群体F0、F1、F2三代、基因组测序与SNP鉴定、杂交群体家系中遗传物质的传递追踪、识别性别拮抗热点区域。通过本发明的方法识别出Chr3:121M窗口是在大白/民猪基因型个体中有利于产生雄性后代的性别比例定向调控分子标记。根据本发明的方法可以预测和调控猪群性别,通过配种前亲本基因型的筛选和优配,在不引入外源血缘的基础上连续横交得到多代次,实现在群体层面保有每一代所有的基因型的情况下,实现对雄性或雌性有利的基因型比例到动态规划的最大值,进而实现对后代仔猪群体性别比例的动态调控。
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公开(公告)号:CN119040478A
公开(公告)日:2024-11-29
申请号:CN202411333826.X
申请日:2024-09-24
Applicant: 中国科学院昆明动物研究所 , 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
IPC: C12Q1/6888 , A01K67/02
Abstract: 本发明涉及一种猪X染色体上与胚胎存活率相关的分子标记及其应用,所述分子标记为猪X染色体上42Mb到92Mb区间,参考基因组版本为Sscrofa11,当所述分子标记携带的杂合子基因型占比增多的时候,雌性胚胎存活率减少;通过减少育种所产生个体的X染色体上42Mb到92Mb区间杂合子基因型的占比,可以提高群体产出母猪的比例。本发明从分子育种角度解析了猪X染色体上与胚胎存活率相关的分子标记,用于指导猪的杂交育种可以达到增加母猪存活率的目的,具有群体调控、高效简便的优点,应用前景好。
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公开(公告)号:CN105543359B
公开(公告)日:2019-05-31
申请号:CN201610003456.2
申请日:2016-01-04
Applicant: 中国科学院昆明动物研究所 , 江西农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及与猪产仔数性状相关的SNP位点,具体涉及猪5号染色体上一个与窝产仔数相关的SNP位点及其引物,属生物技术领域。该SNP位点为基因组版本NCBI Build Sscrofa 10.2的Chr5:9008762;该位点的等位基因为T和C,有C/C、T/C和T/T三种基因型,扩增该位点的引物及延伸引物为:Chr5‑PCRU:5’‑AGG TCT CCT GGG GAG CTT‑3’;Chr5‑PCRL:5’‑GGG CTC GAC CCT GTG ATC‑3’;Chr5‑SNPU:5’‑GAA AAG CTT CAC AGG CCA AGA ATA T‑3’。带有T/C基因型的猪产仔数高于T/T基因型,C为提高猪产仔数的有益等位基因并且T/C杂合猪产仔数最高。本发明的有益效果在于:全基因组重测序方法能够快速、批量地筛选与性状相关的SNP位点或基因,基因组版本NCBI Build Sscrofa 10.2的Chr5:9008762这个SNP位点能够作为遗传标记用于猪的遗传育种提高母猪的产仔数。
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公开(公告)号:CN105543359A
公开(公告)日:2016-05-04
申请号:CN201610003456.2
申请日:2016-01-04
Applicant: 中国科学院昆明动物研究所 , 江西农业大学
CPC classification number: C12Q1/6888 , C12Q2600/124 , C12Q2600/156
Abstract: 本发明涉及与猪产仔数性状相关的SNP位点,具体涉及猪5号染色体上一个与窝产仔数相关的SNP位点及其引物,属生物技术领域。该SNP位点为基因组版本NCBI Build Sscrofa 10.2的Chr5:9008762;该位点的等位基因为T和C,有C/C、T/C和T/T三种基因型,扩增该位点的引物及延伸引物为:Chr5-PCRU:5’-AGG TCT CCT GGG GAG CTT-3’;Chr5-PCRL:5’-GGG CTC GAC CCT GTG ATC-3’;Chr5-SNPU:5’-GAA AAG CTT CAC AGG CCA AGA ATA T-3’。带有T/C基因型的猪产仔数高于T/T基因型,C为提高猪产仔数的有益等位基因并且T/C杂合猪产仔数最高。本发明的有益效果在于:全基因组重测序方法能够快速、批量地筛选与性状相关的SNP位点或基因,基因组版本NCBI Build Sscrofa 10.2的Chr5:9008762这个SNP位点能够作为遗传标记用于猪的遗传育种提高母猪的产仔数。
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公开(公告)号:CN103757011A
公开(公告)日:2014-04-30
申请号:CN201310729511.2
申请日:2013-12-26
Applicant: 中国科学院昆明动物研究所 , 江西农业大学
Abstract: 本发明涉及与猪产仔数性状相关的分子标记,具体涉及猪5号染色体上一个与产仔数相关的分子标记及其引物,属生物技术领域。该分子标记位点为基因组版本NCBI?Build?Sscrofa10.2的Chr5:32275545;该位点的等位基因为T和C,有C/C、T/C和T/T三种基因型,该位点及其侧翼序列如SEQ?ID?NO:1所示。扩增权利要求1所述分子标记位点的引物及延伸引物为:Chr5-PCRU:5’-TGC?TGA?AGA?GAG?GAT?TTC?ACA-3’;Chr5-PCRL:5’-AAG?AAG?ATG?CTT?CAC?TAC?CAG?C-3’;Chr5-SNPU:5’-CTG?ACT?GAC?TAA?GGG?TAT?GTG?GAG?CTA?AGA?CAC?AT-3’。带有T/T基因型的猪产仔数高于T/C和C/C基因型。本发明的有益效果在于:运用全基因组重测序方法,能够快速、批量地筛选与性状相关的分子标记或候选基因,Chr5:32275545这个位点能够作为遗传标记用于猪的遗传育种提高母猪的产仔数。
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公开(公告)号:CN103757008A
公开(公告)日:2014-04-30
申请号:CN201310728457.X
申请日:2013-12-26
Applicant: 中国科学院昆明动物研究所 , 江西农业大学
Abstract: 本发明涉及与猪产仔数性状相关的分子标记,具体涉及猪6号染色体上一个与产仔数相关的分子标记及其引物,属生物技术领域。该分子标记位点为基因组版本NCBI?Build?Sscrofa10.2的Chr6:69081465;该位点的等位基因为T和C,有C/C、T/C和T/T三种基因型,该位点及其侧翼序列如SEQ?ID?NO:1所示。扩增该分子标记位点的引物及延伸引物为:Chr6-PCRU:5’-ATT?TAC?CAG?AAA?ACA?CCC?AGG-3’;Chr6-PCRL:5’-TTT?TCA?TCA?TCC?CTT?CTA?ATC?TTC-3’;Chr6-SNPU:5’-ACT?GAC?TGA?CTG?ACT?AAA?AGT?ATT?TCA?GTG?GCA?GCG?AGA?G-3’。带有T/T基因型的猪产仔数高于T/C和C/C基因型。本发明的有益效果在于:运用全基因组重测序方法,能够快速、批量地筛选与性状相关的分子标记或候选基因,Chr6:69081465这个位点能够作为遗传标记用于猪的遗传育种提高母猪的产仔数。
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公开(公告)号:CN103757004A
公开(公告)日:2014-04-30
申请号:CN201310727912.4
申请日:2013-12-26
Applicant: 中国科学院昆明动物研究所 , 江西农业大学
Abstract: 本发明涉及与猪产仔数性状相关的分子标记,具体涉及猪10号染色体上一个与产仔数相关的分子标记及其引物,属生物技术领域。该分子标记位点为基因组版本NCBI?Build?Sscrofa?10.2的Chr10:16018894;该位点的等位基因为T和C,有C/C、T/C和T/T三种基因型,该位点及其侧翼序列如SEQ?ID?NO:1所示。扩增该分子标记位点的引物及延伸引物为:Chr10-PCRU:5’-TGC?CAA?ACC?TGT?GTC?ACC-3’;Chr10-PCRL:5’-GGC?TGG?AGA?GGA?AAA?GGG-3’;Chr10-SNPU:5’-TGA?CTA?GAA?GCA?GCC?ATG?GGG?CCC?TGC?AGA-3’。带有T/T基因型的猪产仔数高于T/C和C/C基因型。本发明的有益效果在于:运用全基因组重测序方法,能够快速、批量地筛选与性状相关的分子标记或候选基因,Chr10:16018894这个位点能够作为遗传标记用于猪的遗传育提高母猪的产仔数。
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公开(公告)号:CN105567817A
公开(公告)日:2016-05-11
申请号:CN201610003324.X
申请日:2016-01-04
Applicant: 中国科学院昆明动物研究所 , 江西农业大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6888 , C12Q2600/124 , C12Q2600/156
Abstract: 本发明涉及与猪产仔数性状相关的SNP位点,具体涉及猪4号染色体上一个与窝产仔数相关的SNP位点及其引物,属生物技术领域。该SNP位点为基因组版本NCBI Build Sscrofa 10.2的Chr4:37340666;该位点的等位基因为T和C,有C/C、T/C和T/T三种基因型,扩增该位点的引物及延伸引物为:Chr4-1-PCRU:5’-TGG ACA GGG TCT CAC AAT T-3’;Chr4-1-PCRL:5’-TTC TGC AAT CTC TCC TGA ATT C-3’;Chr4-1-SNPU:5’-CTG ACT GAC TTG GGT CTT CAG GAA ATT GCC CCC AA-3’。带有T/C基因型的猪产仔数高于T/T基因型,C为提高猪产仔数的有益等位基因并且T/C杂合猪产仔数最高。本发明的有益效果在于:全基因组重测序方法能够快速、批量地筛选与性状相关的SNP位点或基因,基因组版本NCBI Build Sscrofa 10.2的Chr4:37340666这个SNP位点能够作为遗传标记用于猪的遗传育种提高母猪的产仔数。
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