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公开(公告)号:CN117568530A
公开(公告)日:2024-02-20
申请号:CN202311558604.3
申请日:2023-11-21
Applicant: 之江实验室
IPC: C12Q1/70 , C12Q1/6844 , C12N15/113 , C12N15/11 , C12M1/34 , C12M1/00 , G01N21/64 , C12R1/93
Abstract: 本发明公开了一种用于人乳头瘤病毒快速可视化分型的试剂盒,涉及分子生物学诊断技术领域。本发明通过将等温扩增技术与CRISPR/Cas12a检测技术相结合,仅通过简单常见的加热装置即可实现多靶标的特异性扩增,且可避免交叉扩增,摆脱了对于专业PCR仪器的依赖性;本发明针对不同靶序列设计的差异性crRNA可特异性识别靶序列,实现对HPV不同亚型的鉴定,该方法为基层实验室和临床提供了一个准确、快速、简便的HPV分型检测方法。
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公开(公告)号:CN117210584A
公开(公告)日:2023-12-12
申请号:CN202310918959.2
申请日:2023-07-25
Applicant: 之江实验室
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6844 , C12N15/113 , C12N15/11 , C12R1/35 , C12R1/46 , C12R1/01
Abstract: 本发明公开了一种用于肺炎链球菌、流感嗜血杆菌、肺炎衣原体和肺炎支原体核酸多重检测的试剂盒,涉及生物技术领域。本研亢选取痰液样本作为检测对象具有较大的临床意义。肺脏深部的痰液可以比较准确地反应肺组织内部病原微生物的感染情况,而且该取样方法属于无创取样,不会对患者造成比较大的应激反应。该检测方法可以高灵敏高特异性地检测痰液中肺炎链球菌、流感嗜血杆菌、肺炎衣原体和肺炎支原体,因此具有较重要的临床价值。目前市场上开发了基于Cas12a的单病原菌检测方法,该方法虽然可以快速准确地检测病原微生物感染,但是检测覆盖范围窄,检测成本相对较高,而RPA/CRISPR检测方法有利于克服以上不足之处。
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公开(公告)号:CN119361019A
公开(公告)日:2025-01-24
申请号:CN202411908549.0
申请日:2024-12-24
Applicant: 之江实验室 , 上海人工智能创新中心
Abstract: 本申请涉及新型抗菌肽序列的智能生成方法、系统及计算机设备,包括:将包含多序列比对的第一抗菌肽序列数据集输入至预训练好的生成器中,根据预设条件输出新型的第一候选抗菌肽序列集;将第一候选抗菌肽序列集输入至预训练好的判别器中,以判别出属于抗菌肽序列的第二候选抗菌肽序列集;将第二候选抗菌肽序列集输入至预训练好的预测器中,以预测第二候选抗菌肽序列集中各第二候选抗菌肽序列的抗菌活性;基于各第二候选抗菌肽序列的抗菌活性,在各第二候选抗菌肽序列集中选择出至少一条最优的目标抗菌肽序列。本申请利用生成器能够捕捉序列多样性,生成更广谱的抗菌肽序列,通过判别器和预测器的级联优化,生成的抗菌肽序列具备更高的抗菌活性。
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公开(公告)号:CN120072028A
公开(公告)日:2025-05-30
申请号:CN202411917560.3
申请日:2024-12-24
Applicant: 之江实验室 , 上海人工智能创新中心
IPC: G16B15/00 , G16B40/00 , G06F18/214 , G06N3/0442 , G06N3/0455 , G06N3/084
Abstract: 本申请涉及一种基于LSTM模型的抗菌肽序列的抗菌活性预测方法及系统,方法包括:构建训练样本训练集,样本训练集包括正样本集和负样本集,正样本集包括经过预处理的目标菌属的抗菌肽序列,负样本集包括经过预处理的非抗菌肽序列;利用预训练的蛋白质语言模型提取样本训练集的第一高维嵌入特征;以样本训练集的抗菌活性作为标签,利用第一高维嵌入特征对初始的LSTM模型进行训练,得到训练好的LSTM模型;利用蛋白质语言模型提取待预测的抗菌肽序列的第二高维嵌入特征,将第二高维嵌入特征输入至训练好的LSTM模型,输出待预测的抗菌肽序列的抗菌活性。本申请显著提升抗菌活性预测的准确性。
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公开(公告)号:CN119361020A
公开(公告)日:2025-01-24
申请号:CN202411908673.7
申请日:2024-12-24
Applicant: 之江实验室 , 上海人工智能创新中心
Abstract: 本申请涉及一种基于生成式模型的抗菌肽生成方法、装置及计算机设备,涉及人工智能、生物信息学技术领域,通过获取现有的抗菌肽序列的集合;利用预训练的生成式模型,在现有的抗菌肽序列的基础上预测新型抗菌肽,得到预测序列;将所述预测序列输入预训练的抗菌肽分类器,判断所述预测序列是否具有抗菌活性;所述抗菌肽分类器基于抗菌肽标签集和非抗菌肽序标签集训练得到;将具有抗菌活性的所述预测序列作为最终的目标抗菌肽序列进行输出,解决了抗菌肽设计生成效率低的问题,能够借助生成式模型和分类器,实现对抗菌肽的从头生成和判定,提高了生成效率和准确性。
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公开(公告)号:CN117947212A
公开(公告)日:2024-04-30
申请号:CN202311717282.2
申请日:2023-12-13
Applicant: 之江实验室
IPC: C12Q1/70 , C12Q1/6844 , C12N15/113 , C12N15/11 , C12R1/93
Abstract: 本发明公开了一种用于四种猪腹泻类病毒核酸多重检测的试剂盒,涉及分子生物学诊断技术领域。本研究选取PCR扩增的DNA产物和临床肛拭子样品作为检测模板,能够达到准确检测的目标。该检测方法可以高灵敏高特异地检测到四种病毒核酸,检测下限可达1×101拷贝/μl,具有较重要的生产实践价值。该检测方法能够克服已有检测方法的检测覆盖范围窄和检测成本相对较高的不足之处,实现单次四重检测。
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公开(公告)号:CN116287449A
公开(公告)日:2023-06-23
申请号:CN202310090300.2
申请日:2023-01-12
Applicant: 之江实验室
IPC: C12Q1/70 , C12Q1/6844 , G01N33/558 , C12R1/93
Abstract: 本发明涉及生物技术领域,具体涉及一种用于人乳头瘤病毒核酸快速分型检测的试剂盒。本发明通过利用Cpf1特异识别核酸联合免疫测流层析技术,实现对6种亚型HPV(HPV6、HPV11、HPV16、HPV18、HPV31、HPV33)核酸的高灵敏度、高特异性及快速可视化检测。HPV高保守性的L1基因被作为检测靶序列。本发明是一种基于Cpf1的核酸快速检测工具,该工具可实现一步法的核酸等温扩增与Cpf1检测流程,并包含免疫层析条带,能实现方便快捷的结果判读。本发明基于设计的序列差异性crRNA,可实现对HPV不同亚型的鉴定,该方法为基层实验室和生产一线提供了一个准确、快速、简便的HPV分型检测方法。
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公开(公告)号:CN221777885U
公开(公告)日:2024-09-27
申请号:CN202323122286.4
申请日:2023-11-20
Applicant: 之江实验室
Abstract: 本实用新型公开了一种用于核酸恒温反应及可视化的荧光检测装置,包括带有拓展支架板的装置壳体,收纳在装置壳体内部的恒温加热机构,以及位于在装置壳体外部的核酸检测机构;所述拓展支架板包括与装置壳体外表面相对布置的观察板,以及用于连接装置壳体和观察板的连接板;所述恒温加热机构用于提供稳定的核酸扩增反应温度,所述核酸检测机构包括布置在装置壳体与观察板之间的EP检测管支架及激发光源;所述观察板设有用于观察EP检测管中反应结果的滤光片;所述连接板相对EP检测管支架下方的一侧设有用于激发光源固定的安装滑槽。本实用新型提供的装置操作便捷且能满足多种场景下的临时检测需求。
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