公开(公告)号：CN111501106A

公开(公告)日：2020-08-07

申请号：CN202010336574.1

申请日：2020-04-24

申请人： 北京吉因加科技有限公司 ,  北京吉因加医学检验实验室有限公司

发明人： 杨玲 ,  管彦芳 ,  张燕艳 ,  姬利延 ,  贾明玺

IPC分类号： C40B50/06 ,  C40B40/06 ,  C40B60/08 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q1/6883

摘要： 本发明公开了一种外泌体RNA的高通量测序文库的构建方法，包括：提取外泌体的总RNA；将总RNA进行片段化处理，得到片段化的RNA；将片段化的RNA逆转录为双链cDNA；在双链cDNA的5’端和3’端连接测序接头，得到接头连接产物；PCR扩增接头连接产物，得到富集的接头连接产物；从富集的接头连接产物中分离单链DNA，将单链DNA进行环化处理，获得环状DNA，环状DNA构成外泌体RNA的高通量测序文库。上述构建方法能够实现对低起始量的外泌体RNA的测序文库的构建，测序结果广泛覆盖mRNA、miRNA、lncRNA等各类RNA，在疾病早期诊断、预后评估、疗效监测及治疗方法研究等方面具有重要价值。

公开(公告)号：CN110820050A

公开(公告)日：2020-02-21

申请号：CN201911159400.6

申请日：2019-11-22

申请人： 北京吉因加科技有限公司 ,  苏州吉因加生物医学工程有限公司

发明人： 张燕艳 ,  杨玲 ,  管彦芳 ,  姬利延 ,  贾明玺 ,  张珍

IPC分类号： C40B40/06 ,  C40B50/06 ,  C12Q1/6858

摘要： 本发明涉及生物信息学技术领域，具体涉及一种全基因组甲基化非重亚硫酸氢盐的测序文库及构建、用途，包括TET酶反应液，所述TET酶反应液包括如下独立包装的组分：TET酶氧化缓冲液；所述TET酶氧化缓冲液包括如下微摩尔份的组分：HEPES或Tris–Cl(20-167)×103份，NaCl(100-333)×103份，α-KG或2-oxoglutarate 3.3×103份，抗坏血酸6.67×103份，和三磷酸腺苷4×103份；采用上述试剂盒结合Fe(NH4)2(SO4)2以及TET酶可以将5mc氧化为5cac，5cac在还原剂作用下被还原为二氢尿嘧啶，经PCR测序识别为T，实现在非重亚硫酸氢盐条件下的DNA甲基化“C”到“T”转化，解决现有的基于亚硫酸氢盐转化构建的甲基化测序文库存在的碱基不平衡，测序数据使用率低的缺陷，该配方还具有组分精简，TET酶使用量极低，显著降低成本的效果。