公开(公告)号：CN116343949A

公开(公告)日：2023-06-27

申请号：CN202310370233.X

申请日：2023-04-07

申请人： 北京深势科技有限公司

发明人： 昌珺涵 ,  张与之 ,  邓彧勍 ,  罗伟梁 ,  王应泽 ,  黄逍 ,  王新颜 ,  袁奉博 ,  郑行 ,  张林峰 ,  孙伟杰

IPC分类号： G16C20/50 ,  G16B15/30 ,  G16C10/00

摘要： 本发明提供了一种蛋白配体结合亲和力预测方法、装置、系统及存储介质，涉及药物设计技术领域。所述蛋白配体结合亲和力预测方法包括：根据蛋白配体分子构象，获取与蛋白配体分子构象对应的相似配体；进行配体分子对齐；构建微扰图；进行分子动力学模拟获得模拟数据；根据模拟数据进行自由能计算，并得出蛋白配体分子构象与对应的目标靶向蛋白之间的亲和力。本发明提供了一种FEP完整解决方案，将自由能微扰理论、分子动力学和高性能计算相结合，能够以化学精度高效评估蛋白质与配体的结合亲和力，设计和计算过程简便，大大提高了药物设计的精度和准确度。