公开(公告)号：CN104751014A

公开(公告)日：2015-07-01

申请号：CN201510130954.9

申请日：2015-03-25

Applicant: 华中科技大学

Inventor： 石晓龙 ,  陈智华 ,  张征 ,  潘林强 ,  刘倩 ,  宋弢 ,  王之煜 ,  武晓旭 ,  陈从周 ,  沈涛

IPC: G06F19/12

Abstract: 本发明提供了一种三输入三输出的DNA算法自组装六边形结构模型，其三输入三输出六边形结构子单元由一条DNA单链组成，六边形单链的六条边使用不同的编码序列，在三个方向上能够执行三输入三输出的算法。并以基于该DNA六边形模型通过碱基互补配对执行异或逻辑而构成异或门合成Sierpinski三角形为例来证明其自组装逻辑的可靠性。该模型能够有效改善传统的算法自组装的错配率较大的问题，提高了自组装的可靠性。由于六边形结构具有三个输入输出方向，单个六边形结构模型最多能够实现三输入三输出的逻辑功能，而多个六边形结构级联能实现多输入输出的更复杂的运算，这在DNA计算领域将是一个突破。

公开(公告)号：CN104751013A

公开(公告)日：2015-07-01

申请号：CN201510132195.X

申请日：2015-03-25

Applicant: 华中科技大学

Inventor： 陈智华 ,  石晓龙 ,  张征 ,  潘林强 ,  刘倩 ,  宋弢 ,  王之煜 ,  武晓旭 ,  陈从周 ,  沈涛

IPC: G06F19/10

Abstract: 本发明提供了一种DNA tile自组装平面网格设计方法，其主要包括两步，由4个sub-tile通过碱基互补配对合成4-arm tile和由合成的不同黏性末端类型的4-arm tile互补连接而成平面网格结构。通过DNA tile自组装构造出4-arm tile进而可构造出大小为的平面网格正方形结构，其平面结构的横行和纵列的4-arm tile的数量分别是，且其中可以是任意正整数。本发明提出的基于sub-tile策略的DNA tile自组装平面网格设计方法过程简单可控，充分利用DNA自组装可编程特性，可形成有限尺寸的DNA二维平面网格结构。

公开(公告)号：CN104750921A

公开(公告)日：2015-07-01

申请号：CN201510132221.9

申请日：2015-03-25

Applicant: 华中科技大学

Inventor： 石晓龙 ,  陈智华 ,  张征 ,  潘林强 ,  刘倩 ,  宋弢 ,  王之煜 ,  武晓旭 ,  陈从周 ,  沈涛

IPC: G06F17/50

Abstract: 本发明提供了一种基于DNA算法自组装的可编程平面网络结构设计方法，其包括若干个具有特异性黏性末端的6-arm tile可编程自组装形成任意图案的分子平面网络结构，以及由6个sub-tile通过碱基互补配对合成6-arm tile的方法。算法自组装平面网络结构具有包括三角形、六边形等形状在内的任意可编程平面形状。基于DNA算法自组装的可编程平面网络结构设计方法组装出来的平面图案形状可控并具有有限大小，用于组装的DNA链重用性优良，而且越复杂的结构体现得越明显，且组装出来的图案可以不必是传统方形网格的形状。